MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2168112717 · doi:10.1095/biolreprod.107.066449

Effects of Vasectomy on Gene Expression Profiling along the Human Epididymis1

2008· article· en· W2168112717 sur OpenAlexafffund
Véronique Thimon, Ézéquiel Calvo, Omédine Koukoui, Christine Légaré, Robert Sullivan

Notice bibliographique

RevueBiology of Reproduction · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineHealth Professions
ThématiqueMale Reproductive Health Studies
Établissements canadiensUniversité LavalCentre hospitalier de l'Université Laval
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésVasectomyEpididymisBiologyAndrologyGene expressionGeneGene expression profilingWestern blotMicroarrayMicroarray analysis techniquesGeneticsPopulationSpermMedicineFamily planningResearch methodology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Worldwide, almost 100 million men rely on vasectomy for male contraceptive purposes. Due to changes in their personal lives, an increasing number of these men request surgical vasectomy reversal. Unfortunately, a significant proportion of these men remain infertile, despite the reestablishment of patent ducts, possibly due to epididymal damage caused by vasectomy. In animal models, vasectomy affects different epididymal physiological and biochemical parameters. However, the consequences of vasectomy on epididymal function are poorly understood. Furthermore, results obtained with animal models cannot be extrapolated to humans to understand the consequences of vasectomy on epididymal function. Gene expression along the epididymis is highly regulated. We previously showed that the human epididymal expression pattern of two genes is altered after vasectomy. To complete the list of epididymal genes affected by vasectomy, we analyzed the epididymal gene expression pattern of three vasectomized donors using the Affymetrix human GeneChip U133 Plus 2. These results were compared with the gene expression pattern of three "normal" donors. The data generated allowed the identification of many human epididymal genes for which expression is modified after vasectomy. Quantitative (Qt)-PCR and Western blot analysis of six selected genes known to be expressed in specific epididymal segments were performed. The Qt-PCR results confirmed the selected transcripts expression pattern deduced from microarray data. However, Western blot analysis revealed some differences in protein distribution along the epididymis when compared with the encoding transcripts expression pattern. These results contribute to an understanding of the reasons why fertility is not recovered in vasovasostomized men, even though spermogram values suggest surgical success of vasectomy reversal.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,099
Tête enseignante GPT0,422
Écart entre enseignants0,324 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations41
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBiology of ReproductionMême sujetMale Reproductive Health StudiesTravaux en français237 207