MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2168114460 · doi:10.1093/protein/13.3.143

NMR study of the differential contributions of residues of transforming growth factor alpha to association with its receptor

2000· article· en· W2168114460 sur OpenAlexaff
Campbell McInnes, Suzanne Grothé, Maureen D. O'Connor‐McCourt, Brian D. Sykes

Notice bibliographique

RevueProtein Engineering Design and Selection · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHER2/EGFR in Cancer Research
Établissements canadiensBiotechnology Research InstituteUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHeteronuclear moleculeReceptorEpitopeTGF alphaTransforming growth factorChemistryLigand (biochemistry)Epidermal growth factor receptorBiophysicsBiochemistryStereochemistryNuclear magnetic resonance spectroscopyBiologyCell biologyGeneticsAntibody

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A heteronuclear NMR study of human transforming growth factor alpha (TGFalpha) in complex with the epidermal growth factor receptor extracellular domain (EGFR-ED) provided an effective method for delineating the relative contributions of the residues of the ligand to its affinity for the receptor. In conjunction with previously obtained mutagenesis data, these results indicate that while a large number of residues are involved in complex formation and make up the binding interface, a small subset contribute most of the binding energy. They also show that while the residues which contribute to receptor binding are localized on one face of the molecule, the specific residues that play the major role in the affinity of TGFalpha in the complex are in two distinct regions of TGFalpha. This suggests that two small functional epitopes each composed of two residues exist within a larger structural epitope presented on the binding face. These results give the most detailed picture to date of the receptor binding determinants and yield further insight into the formation of the ligand-receptor complex.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueProtein Engineering Design and SelectionMême sujetHER2/EGFR in Cancer ResearchTravaux en français237 207