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Enregistrement W2168193627 · doi:10.1158/1078-0432.ccr-07-4723

Analysis of the MammaPrint Breast Cancer Assay in a Predominantly Postmenopausal Cohort

2008· article· en· W2168193627 sur OpenAlexaff
Ben S. Wittner, Dennis C. Sgroi, Paula D. Ryan, Tako J. Bruinsma, Annuska M. Glas, Anitha Male, Sonika Dahiya, Karleen Habin, René Bernards, Daniel A. Haber, Laura J. van’t Veer, Sridhar Ramaswamy

Notice bibliographique

RevueClinical Cancer Research · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBreast Cancer Treatment Studies
Établissements canadiensImmunovaccine (Canada)
Organismes subventionnairesNational Cancer Institute
Mots-clésMedicineBreast cancerOncologyInternal medicineCohortDistant metastasisCancerMetastasis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: Most node-negative breast cancer patients are older and postmenopausal and are increasingly being offered adjuvant chemotherapy despite their low overall risk of distant relapse. A molecular diagnostic test with high negative predictive value (NPV) for distant metastasis in this subgroup would spare many older breast cancer patients adjuvant treatment. EXPERIMENTAL DESIGN: We determined the NPV and positive predictive value of the MammaPrint assay in breast cancer patients who were consecutively diagnosed and treated at the Massachusetts General Hospital between 1985 and 1997. Primary tumors from 100 patients with node-negative, invasive breast cancer (median age, 62.5 years; median follow-up, 11.3 years) were subjected to MammaPrint analysis and classified as being at either low or high risk for distant metastasis. RESULTS: The MammaPrint 70-gene signature displayed excellent NPV as in previous studies, correctly identifying 100% of women at low risk for distant metastases at 5 years. However, this assay had a lower positive predictive value (12% at 5 years) than previously observed. CONCLUSIONS: The MammaPrint assay was originally designed to identify younger breast cancer patients at low risk for distant metastasis, who might consequently be spared systemic treatment. We show here that the same signature has a very high NPV for distant recurrence after adjuvant treatment in older breast cancer patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,726

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,092
Tête enseignante GPT0,458
Écart entre enseignants0,367 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations145
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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