Genetic characterization of a new variant within the ET-37 complex of <i>Neisseria meningitidis</i> associated with outbreaks in various parts of the world
Notice bibliographique
Résumé
A new variant within the electrophoretic type (ET)-37 complex of Neisseria meningitidis, ET-15, first detected in Canada in 1986, has been associated with severe clinical infections and high mortality rates in several European countries, Israel and Australia. To ascertain the genetic and epidemiological relationships of ET-15 strains from different geographical areas, 72 ET-15 isolates from 10 countries were compared to 13 isolates representing other clones of the ET-37 complex. The 85 strains were analysed by pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) using 2 restriction endonucleases and Southern hybridization with 10 genetic markers. Four ET-15 strains and 4 other strains of the ET-37 complex were further examined using an additional restriction enzyme and a total of 18 genetic markers. PFGE fingerprints of the ET-15 strains were closely related. Strains within each country were even more closely related, suggesting single introductions of the clone. Physical mapping of genes in ET-15 and other strains of the ET-37 complex demonstrated that large genetic rearrangements of the genome have occurred in association with the appearance of the ET-15 variant.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».