Comparison of the Luminex xTAG RVP Fast Assay and the Idaho Technology FilmArray RP Assay for Detection of Respiratory Viruses in Pediatric Patients at a Cancer Hospital
Notice bibliographique
Résumé
Respiratory viruses are increasingly recognized as serious causes of morbidity and mortality in immunocompromised patients. The rapid and sensitive detection of respiratory viruses is essential for the early diagnosis and administration of appropriate antiviral therapy, as well as for the effective implementation of infection control measures. We compared the performance of two commercial assays, xTAG RVP Fast (Luminex Diagnostics, Toronto, Canada) and FilmArray RVP (FA RVP; Idaho Technology, Salt Lake City, UT), in pediatric patients at Memorial Sloan-Kettering Cancer Center. These assays detect the following viruses: respiratory syncytial virus; influenza A and B viruses; parainfluenza viruses 1, 2, 3, and 4; human metapneumovirus; adenovirus; enterovirus-rhinovirus; coronaviruses NL63, HKU1, 229E, and OC43; and bocavirus. We tested a total of 358 respiratory specimens from 173 pediatric patients previously tested by direct fluorescence assay (DFA) and viral culture. The overall detection rate (number of positive specimens/total specimens) for viruses tested by all methods was 24% for DFA/culture, 45% for xTAG RVP Fast, and 51% for FA RVP. The agreement between the two multiplex assays was 84.5%, and the difference in detection rate was statistically significant (P < 0.0001). Overall, the FA RVP assay was more sensitive than the xTAG RVP Fast assay and had a turnaround time of approximately 1 h. The sensitivity, simplicity, and random-access platform make FA RVP an excellent choice for laboratory on-demand service with low to medium volume.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,006 | 0,008 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».