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Enregistrement W2168373238 · doi:10.1111/tbed.12388

A Rapid Field-Deployable Reverse Transcription-Insulated Isothermal Polymerase Chain Reaction Assay for Sensitive and Specific Detection of Bluetongue Virus

2015· article· en· W2168373238 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueTransboundary and Emerging Diseases · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueVector-Borne Animal Diseases
Établissements canadiensCanadian Science Centre for Human and Animal HealthCanadian Food Inspection Agency
Organismes subventionnairesCanadian Food Inspection Agency
Mots-clésBiologyVirologyReverse Transcription Loop-mediated Isothermal AmplificationReoviridaeReverse transcriptaseVirusOrbivirusPolymerase chain reactionReverse transcription polymerase chain reactionSerotypeMolecular biologyMessenger RNAGeneticsRotavirusGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bluetongue is a non-contagious, haemorrhagic, Culicoides-borne disease of ruminants. The causative agent, bluetongue virus (BTV), is a member of the Orbivirus genus of the Reoviridae family. So far, 26 BTV serotypes have been identified worldwide. The global distribution of bluetongue has been expanding, and rapid detection of BTV, preferably in the field, is critical for timely implementation of animal movement restrictions and vector control measures. To date, many laboratory-based, molecular assays for detection of BTV have been developed. These methods require the samples to be shipped to a central laboratory with sophisticated instruments and highly skilled technicians to perform the assays, conduct analyses and interpret the results. Here, we report the development and evaluation of a rapid, portable, user-friendly, pan-BTV reverse transcription-insulated isothermal polymerase chain reaction (RT-iiPCR) assay that can potentially be used in low-resource field conditions. The total length of the assay was <60 min, and at the end of the assay, the results were automatically displayed as '+' or '-' without the need for data interpretation. The RT-iiPCR assay detected 36 BTV isolates and two in vitro transcribed RNA samples representing all 26 BTV serotypes. The assay did not cross-react with other animal viruses tested, including two closely related orbiviruses. The analytical sensitivity of the assay was as low as nine copies of in vitro transcribed double-stranded BTV RNA. Analysis of BTV-infected whole blood samples showed that the BTV RT-iiPCR assay was as sensitive as real-time RT-PCR. The assay can potentially be used for rapid screening of animals for BTV in routine diagnostics and for monitoring bluetongue outbreaks both in ruminants and in Culicoides vectors in the field and in the laboratory.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,555
Score d'incertitude au seuil0,370

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,201 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle