Probabilistic Models of Chromosome Number Evolution and the Inference of Polyploidy
Pourquoi ce travail est-il dans la base ?
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Prédiction distillée sur la base complète
Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
- Catégories candidates
- aucune
- Catégories consensuelles
- aucune
- Domaine
- Signal candidat: aucuneSignal consensuel: aucune
- Devis d'étude
- Signal candidat: Théorique ou conceptuelSignal consensuel: Théorique ou conceptuel
- Genre
- Signal candidat: EmpiriqueSignal consensuel: Empirique
- Score de désaccord entre enseignants
- 0,203
- Score d'incertitude au seuil
- 0,074
- Statut de validation
machine_predicted_unvalidated·codex-gemma-dda1882f352a
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
- Écart entre enseignants
- 0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
- Statut de validation
score_only:v0-immature-baseline· tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle
Résumé
Polyploidy, the genome wide duplication of chromosome number, is a key feature in eukaryote evolution. Polyploidy exists in diverse groups including animals, fungi, and invertebrates but is especially prevalent in plants with most, if not all, plant species having descended from a polyploidization event. Polyploids often differ markedly from their diploid progenitors in morphological, physiological, and life history characteristics as well as rates of adaptation. The altered characteristics displayed by polyploids may contribute to their success in novel ecological habitats. Clearly, a better understanding of the processes underlying changes in the number of chromosomes within genomes is a key goal in our understanding of speciation and adaptation for a wide range of families and genera. Despite the fundamental role of chromosome number change in eukaryotic evolution, probabilistic models describing the evolution of chromosome number along a phylogeny have not yet been formulated. We present a series of likelihood models, each representing a different hypothesis regarding the evolution of chromosome number along a given phylogeny. These models allow us to reconstruct ancestral chromosome numbers and to estimate the expected number of polyploidization events and single chromosome changes (dysploidy) that occurred along a phylogeny. We test, using simulations, the accuracy of this approach and its dependence on the number of taxa and tree length. We then demonstrate the application of the method for the study of chromosome number evolution in 4 plant genera: Aristolochia, Carex, Passiflora, and Helianthus. Considering the depth of the available cytological and phylogenetic data, formal models of chromosome number evolution are expected to advance significantly our understanding of the importance of polyploidy and dysploidy across different taxonomic groups.
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La notice
- Revue
- Systematic Biology
- Thématique
- Plant Taxonomy and Phylogenetics
- Domaine
- Agricultural and Biological Sciences
- Établissements canadiens
- University of British Columbia
- Organismes subventionnaires
- non disponible
- Mots-clés
- BiologyPloidyChromosomePhylogeneticsEvolutionary biologyPhylogenetic treePlant evolutionGenome sizeGenomeGeneticsGene
- Résumé présent dans OpenAlex
- oui