Mapping tightly linked genes controlling potyvirus infection at the <i>Rsv1</i> and <i>Rpv1</i> region in soybean
Notice bibliographique
Résumé
Soybean mosaic virus (SMV) and peanut mottle virus (PMV) are two potyviruses that cause yield losses and reduce seed quality in infested soybean (Glycine max (L.) Merr.) fields throughout the world. Rsv1 and Rpv1 are genes that provide soybean with resistance to SMV and PMV, respectively. Isolating and characterizing Rsv1 and Rpv1 are instrumental in providing insight into the molecular mechanism of potyvirus recognition in soybean. A population of 1056 F2 individuals from a cross between SMV- and PMV-resistant line PI 96983 (Rsv1 and Rpv1) and the susceptible cultivar 'Lee 68' (rsv1 and rpv1) was used in this study. Disease reaction and molecular-marker data were collected to determine the linkage relationship between Rsv1, Rpv1, and markers that target candidate disease-resistance genes. F2 lines showing a recombination between two of three Rsv1-flanking microsatellite markers were selected for fine mapping. Over 20 RFLP, RAPD, and microsatellite markers were used to map 38 loci at high-resolution to a 6.8-cM region around Rsv1 and Rpv1. This study demonstrates that Rsv1 and Rpv1 are tightly linked at a distance of 1.1 cM. In addition, resistance-gene candidate sequences were mapped to positions flanking and cosegregating with these resistance loci. Based on comparisons of genetic markers and disease reactions, it appears likely that several tightly linked genes are conditioning a resistance response to SMV. We discuss the specifics of these findings and investigate the utility of two disease resistance related probes for the screening of SMV or PMV resistance in soybean.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».