Spectrum of mutations in<i>mut</i>methylmalonic acidemia and identification of a common Hispanic mutation and haplotype
Notice bibliographique
Résumé
Cobalamin nonresponsive methylmalonic acidemia (MMA, mut complementation class) results from mutations in the nuclear gene MUT, which codes for the mitochondrial enzyme methylmalonyl CoA mutase (MCM). To better elucidate the spectrum of mutations that cause MMA, the MUT gene was sequenced in 160 patients with mut MMA. Sequence analysis identified mutations in 96% of disease alleles. Mutations were found in all coding exons, but predominantly in exons 2, 3, 6, and 11. A total of 116 different mutations, 68 of which were novel, were identified. Of the 116 different mutations, 53% were missense mutations, 22% were deletions, duplications or insertions, 16% were nonsense mutations, and 9% were splice-site mutations. Sixty-one of the mutations have only been identified in one family. A novel mutation in exon 2, c.322C>T (p.R108C), was identified in 16 of 27 Hispanic patients. SNP genotyping data demonstrated that Hispanic patients with this mutation share a common haplotype. Three other mutations were seen exclusively in Hispanic patients: c.280G>A (p.G94R), c.1022dupA, and c.970G>A (p.A324T). Seven mutations were seen almost exclusively in black patients, including the previously reported c.2150G>T (p.G717V) mutation, which was identified in 12 of 29 black patients. Two mutations were seen only in Asian patients. Some frequently identified mutations were not population-specific and were identified in patients of various ethnic backgrounds. Some of these mutations were found in mutation clusters in exons 2, 3, 6, and 11, suggesting a recurrent mutation.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».