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Enregistrement W2168696269 · doi:10.1046/j.1460-9568.2003.02618.x

Regulation of α1G T‐type calcium channel gene (CACNA1G) expression during neuronal differentiation

2003· article· en· W2168696269 sur OpenAlexaff
Gabriel E. Bertolesi, Christine A. B. Jollimore, Chanjuan Shi, Lindsy Elbaum, Eileen M. Denovan‐Wright, Steven Barnes, Melanie E. M. Kelly

Notice bibliographique

RevueEuropean Journal of Neuroscience · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRepressorPromoterBiologyEnhancerMolecular biologyGeneGene expressionRegulation of gene expressionCellular differentiationTranscription (linguistics)Regulatory sequenceGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Down-regulation of T-type Ca channel current and mRNA occurs following differentiation of Y79 retinoblastoma cells. To understand how the decrease in expression is linked to cell differentiation, we examined transcriptional regulation of the Cav3.1 Ca channel gene, CACNA1G. We identified two putative promoters (A and B) in 1.3 kb of cloned genomic DNA. Reverse transcriptase-polymerase chain reaction and 5' rapid amplification of cDNA ends-polymerase chain reaction analyses demonstrated that two transcripts with different 5' untranslated regions are generated by different transcription start sites, with promoter A favoured in undifferentiated cells and promoter B favoured in differentiated cells. Functional analyses of the promoter sequence revealed that both promoters are active. Enhancer and repressor sequences were identified upstream of promoter A and B, respectively. These results suggest that the down-regulation of alpha1G mRNA in differentiated Y79 cells is mediated primarily by decreased activity of promoter A, which could occur in conjunction with repression of the activity of promoter B. The decrease in T-type Ca channel expression in Y79 cells may be an essential signal affecting phenotypic maturation and expression of other ion channel subtypes in the differentiated cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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