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Enregistrement W2168710431 · doi:10.1002/gcc.20096

Expression profiles and clinical relationships of <i>ID2</i>, <i>CDKN1B</i>, and <i>CDKN2A</i> in primary neuroblastoma

2004· article· en· W2168710431 sur OpenAlexfundno aff
Sigrun Gebauer, Alice L. Yu, Motoko Omura‐Minamisawa, Ayse Batova, Mitchell B. Diccianni

Notice bibliographique

RevueGenes Chromosomes and Cancer · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeuroblastoma Research and Treatments
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesMcMaster University
Mots-clésNeuroblastomaPrimary (astronomy)Cancer researchOncologyInternal medicineExpression (computer science)CDKN2AMedicineBiologyComputer scienceGeneticsPhysicsCancerCell culture

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Despite considerable research into the etiology of neuroblastoma, the molecular basis of this disease has remained elusive. In contrast to the absence of expression of the known tumor suppressor CDKN2A (also known as p16 and INK4A) in a wide variety of tumor types we have found in previous studies that CDKN2A protein is paradoxically highly expressed in many advanced stage neuroblastomas and unrelated to RB1 status. In the present study, we sought to identify the mechanistic relationships that might influence CDKN2A expression and negate its influence on tumor cell proliferation. In this regard, we examined the role of the tumor-suppressor gene CDKN1B (also known as p27 and Kip1) and the oncogene ID2 in relationship to CDKN2A expression, MYCN amplification, and neuroblastoma pathogenesis in 17 neuroblastoma cell lines and 129 samples of primary tumors of all stages. All neuroblastoma cell lines expressed the ID2 transcript and protein. However, although the majority of primary neuroblastomas also expressed the ID2 transcript, expression of the ID2 protein was undetectable or only barely detectable, regardless of transcript expression. In both cell lines and primary tumors, ID2 expression was independent of both CDKN2A and MYCN expression. In primary neuroblastomas, CDKN1B protein was expressed in significantly fewer advanced-stage neuroblastomas than early-stage neuroblastomas, but its expression had no relationship with CDKN2A expression or MYCN amplification. We concluded that the paradoxical expression of CDKN2A in neuroblastoma cannot be explained by inactivation of the tumor-suppressor gene CDKN1B or overexpression of the oncogene ID2. We further concluded that ID2 is not a target of MYCN regulation nor is it a prognostic factor for neuroblastoma. Finally, the loss of CDKN1B in advanced-stage neuroblastoma suggests this protein may play a role in the neuroblastoma disease process.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,110
Score d'incertitude au seuil0,502

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,315
Écart entre enseignants0,285 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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