MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2168735601 · doi:10.1111/j.1365-2958.2004.04045.x

An amino‐terminal domain of <i>Enterococcus faecalis</i> aggregation substance is required for aggregation, bacterial internalization by epithelial cells and binding to lipoteichoic acid

2004· article· en· W2168735601 sur OpenAlexaff
Christopher M. Waters, Helmut Hirt, John K. McCormick, Patrick M. Schlievert, Carol L. Wells, Gary M. Dunny

Notice bibliographique

RevueMolecular Microbiology · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntimicrobial Resistance in Staphylococcus
Établissements canadiensLawson Health Research Institute
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institute of General Medical SciencesNational Heart, Lung, and Blood Institute
Mots-clésLipoteichoic acidEnterococcus faecalisInternalizationBiologyAmino acidPlasmidBiochemistryBinding domainTeichoic acidMutantPeptide sequenceBinding siteCell wallEscherichia coliBacteriaCellStaphylococcus aureusPeptidoglycanDNAGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Aggregation substance (AS), a plasmid-encoded surface protein of Enterococcus faecalis, plays important roles in virulence and antibiotic resistance transfer. Previous studies have suggested that AS-mediated aggregation of enterococcal cells could involve the binding of this protein to cell wall lipoteichoic acid (LTA). Here, a method to purify an undegraded form of Asc10, the AS of the plasmid pCF10, is described. Using this purified protein, direct binding of Asc10 to purified E. faecalis LTA was demonstrated. Equivalent binding of Asc10 to LTA purified from INY3000, an E. faecalis strain that is incapable of aggregation, was also observed. Surprisingly, mutations in a previously identified aggregation domain from amino acids 473 to 683 that abolished aggregation had no effect on LTA binding. In frame deletion analysis of Asc10 was used to identify a second aggregation domain located in the N-terminus of the protein from amino acids 156 to 358. A purified Asc10 mutant protein lacking this domain showed reduced LTA binding, while a purified N-terminal fragment from amino acids 44-331 had high LTA binding. Like the previously described aggregation domain, the newly identified Asc10((156-358)) aggregation domain was also required for efficient internalization of E. faecalis into HT-29 enterocytes. Thus, Asc10 possess two distinct domains required for aggregation and eukaryotic cell internalization: an N-terminal domain that promotes binding to LTA and a second domain located near the middle of the protein.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,193
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations75
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueMolecular MicrobiologyMême sujetAntimicrobial Resistance in StaphylococcusTravaux en français237 207