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Enregistrement W2168784251 · doi:10.1523/jneurosci.22-01-00082.2002

Identification and Characterization of Novel Human Ca<sub>v</sub>2.2 (α<sub>1B</sub>) Calcium Channel Variants Lacking the Synaptic Protein Interaction Site

2002· article· en· W2168784251 sur OpenAlexafffund
Shuji Kaneko, Conan B. Cooper, Naoto Nishioka, Hironobu Yamasaki, Atsushi Suzuki, Scott E. Jarvis, Akinori Akaike, Masamichi Satoh, Gerald W. Zamponi

Notice bibliographique

RevueJournal of Neuroscience · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchAlberta Heritage Foundation for Medical ResearchFondation pour la Recherche MédicaleMinistry of Education, Culture, Sports, Science and TechnologyHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésIdentification (biology)Calcium channelNeuroscienceCalciumCharacterization (materials science)ChemistryComputational biologyBiologyMaterials scienceNanotechnology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The physical interaction between the presynaptic vesicle release complex and the large cytoplasmic region linking domains II and III of N-type (Ca(v)2.2) calcium channel alpha(1)B subunits is considered to be of fundamental importance for efficient neurotransmission. By PCR analysis of human brain cDNA libraries and IMR32 cell mRNA, we have isolated novel N-type channel variants, termed Ca(v)2.2-Delta1 and Delta2, which lack large parts of the domain II-III linker region, including the synaptic protein interaction site. They appear to be widely expressed across the human CNS as indicated by RNase protection assays. When expressed in tsA-201 cells, both novel variants formed barium-permeable channels with voltage dependences and kinetics for activation that were similar to those observed with the full-length channel. All three channel types exhibited the hallmarks of prepulse facilitation, which interestingly occurred independently of G-protein betagamma subunits. By contrast, the voltage dependence of steady-state inactivation seen with both Delta1 and Delta2 channels was shifted toward more depolarized potentials, and recovery from inactivation of Delta1 and Delta2 channels occurred more rapidly than that of the full-length channel. Moreover, the Delta1 channel was dramatically less sensitive to both omega-conotoxin MVIIA and GVIA than either the Delta2 variant or the full-length construct. Finally, the domain II-III linker region of neither variant was able to effectively bind syntaxin in vitro. These results suggest that the structure of the II-III linker region is an important determinant of N-type channel function and pharmacology. The lack of syntaxin binding hints at a unique physiological function of these channels.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,000
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations74
Publié2002
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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