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Enregistrement W2168790471 · doi:10.1097/01.asn.0000111248.23454.19

Rescue of Defective Branching Nephrogenesis in Renal-Coloboma Syndrome by the Caspase Inhibitor, Z-VAD-fmk

2004· article· en· W2168790471 sur OpenAlexafffund
Patsy Clark, Alison Dziarmaga, Michael R. Eccles, Paul Goodyer

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Society of Nephrology · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRenal and related cancers
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchRoyal Society
Mots-clésBiologyUreteric budApoptosisKidneyProgrammed cell deathInternal medicineKidney developmentMutantEndocrinologyCell biologyCancer researchGeneticsEmbryonic stem cellGeneMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In renal-coloboma syndrome (RCS), null mutations of the PAX2 gene cause renal hypoplasia due to a congenital deficit of nephrons; affected individuals may develop renal insufficiency in childhood. During normal kidney development, PAX2, is expressed at high levels throughout the arborizing ureteric bud (UB); recent observations suggest that one of its key roles is to suppress apoptosis in this collecting duct lineage. The authors hypothesized that increased UB cell apoptosis due to PAX2 haploinsufficiency must directly influence the rate of branching morphogenesis in developing kidney and the number of nephrons that can be formed before birth, when nephrogenesis in humans comes to an end. If so, the authors reasoned that caspase inhibitors might be used to suppress unwanted UB cell apoptosis during kidney development in Pax2(1Neu) mutant mice and rescue the genetic UB branching defect. E17.5 kidneys from Pax2(1Neu) mutant mice had smaller (-25%) longitudinal cross-sectional area and 3.5-fold increase in collecting duct cell apoptosis versus wild-type littermates; mutant E13.5 kidney explants allowed to arborize for 50 h in vitro had 18% fewer terminal branches than wild-types. However, exposure to the caspase inhibitor, Z-VAD-fmk (25 micro M), significantly increased terminal branch number in mutant explants (23%). It also increased branching in wild-type explants, apparently reflecting an effect of Z-VAD-fmk on basal apoptosis induced by ex vivo culture conditions. Similarly, when pregnant mice were injected daily with Z-VAD-fmk (10 micro g/g weight from E10.5 to E17.5), apoptosis of Pax2(1Neu) fetal collecting duct cells was suppressed to 40% of untreated mutants; by E14, terminal branch number was increased to 152% that of untreated litters. These studies support the hypothesis that PAX2 normally optimizes the rate of branching morphogenesis in fetal kidney by suppressing UB apoptosis. Furthermore, it suggests that caspase inhibitors can rescue the branching defect caused by PAX2 mutations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations43
Publié2004
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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