Genetic diversity and geographical dispersal in grapevine clones revealed by microsatellite markers
Notice bibliographique
Résumé
Intravarietal genetic diversification associated with geographical dispersal of a vegetatively propagated species was studied using grapevine Vitis vinifera L. 'Cabernet Sauvignon' as a model. Fifty-nine clonal samples obtained from 7 countries (France, Chile, Spain, Australia, Hungary, USA, and Italy) were analyzed using 84 microsatellite markers. Eighteen polymorphic microsatellite loci (21.4%) were detected, finding 22 different genotypes in the population analyzed with a genetic similarity of over 97%. The presence of chimeric clones was evidenced at locus VMC5g7 by means of a segregation analysis of descendants by self-pollination of a triallelic Chilean clone and by somatic embryogenesis analysis, showing a mutation in L2 cell layer. Only 2 clones (obtained from France and Australia) presented the ancestral genotype, and the most divergent genotype was exhibited by another French clone, which had accumulated 5 somatic mutations. The 2 largest populations considered (from France and Chile) showed a clear divergency in the polymorphisms detected. These antecedents enabled the tracing of geographical dispersal with a phylogenetic hypothesis supporting France as the center of origin of diversification of Cabernet Sauvignon. The results obtained could help to explain diversification processes in other grapevine cultivars. The possibility that this kind of genetic variability occurs in other vegetatively propagated species is discussed, focusing on possible fingerprinting applications.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».