Genome-Wide Association Studies Identify <i>CHRNA5/3</i> and <i>HTR4</i> in the Development of Airflow Obstruction
Pourquoi ce travail est-il dans la base ?
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Prédiction distillée sur la base complète
Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
- Catégories candidates
- aucune
- Catégories consensuelles
- aucune
- Domaine
- Signal candidat: aucuneSignal consensuel: aucune
- Devis d'étude
- Signal candidat: Autre devisSignal consensuel: aucune
- Genre
- Signal candidat: SynthèseSignal consensuel: Synthèse
- Score de désaccord entre enseignants
- 0,958
- Score d'incertitude au seuil
- 0,476
- Statut de validation
machine_predicted_unvalidated·codex-gemma-dda1882f352a
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
- Écart entre enseignants
- 0,326 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
- Statut de validation
score_only:v0-immature-baseline· tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle
Résumé
RATIONALE: Genome-wide association studies (GWAS) have identified loci influencing lung function, but fewer genes influencing chronic obstructive pulmonary disease (COPD) are known. OBJECTIVES: Perform meta-analyses of GWAS for airflow obstruction, a key pathophysiologic characteristic of COPD assessed by spirometry, in population-based cohorts examining all participants, ever smokers, never smokers, asthma-free participants, and more severe cases. METHODS: Fifteen cohorts were studied for discovery (3,368 affected; 29,507 unaffected), and a population-based family study and a meta-analysis of case-control studies were used for replication and regional follow-up (3,837 cases; 4,479 control subjects). Airflow obstruction was defined as FEV(1) and its ratio to FVC (FEV(1)/FVC) both less than their respective lower limits of normal as determined by published reference equations. MEASUREMENTS AND MAIN RESULTS: The discovery meta-analyses identified one region on chromosome 15q25.1 meeting genome-wide significance in ever smokers that includes AGPHD1, IREB2, and CHRNA5/CHRNA3 genes. The region was also modestly associated among never smokers. Gene expression studies confirmed the presence of CHRNA5/3 in lung, airway smooth muscle, and bronchial epithelial cells. A single-nucleotide polymorphism in HTR4, a gene previously related to FEV(1)/FVC, achieved genome-wide statistical significance in combined meta-analysis. Top single-nucleotide polymorphisms in ADAM19, RARB, PPAP2B, and ADAMTS19 were nominally replicated in the COPD meta-analysis. CONCLUSIONS: These results suggest an important role for the CHRNA5/3 region as a genetic risk factor for airflow obstruction that may be independent of smoking and implicate the HTR4 gene in the etiology of airflow obstruction.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
La notice
- Revue
- American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine
- Thématique
- Genetic Associations and Epidemiology
- Domaine
- Biochemistry, Genetics and Molecular Biology
- Établissements canadiens
- Lunenfeld-Tanenbaum Research InstituteOntario Institute for Cancer Research
- Organismes subventionnaires
- National Center for Research ResourcesNational Human Genome Research InstituteNational Heart, Lung, and Blood InstituteNIHR Cambridge Biomedical Research CentreNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesCambridge Institute for Medical Research, University of CambridgeEngineering and Physical Sciences Research CouncilNational Center for Advancing Translational SciencesMedical Research CouncilAbbott DiagnosticsCenters for Medicare and Medicaid ServicesAgency for Healthcare Research and QualityNational Institute on AgingNational Institute for Health and Care ResearchCentre for Cognitive Ageing and Cognitive EpidemiologyEconomic and Social Research CouncilCOPD FoundationBundesamt für GesundheitBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilCancer Research UKWellcome TrustAXA Research FundNational Institutes of HealthU.S. Department of Veterans AffairsSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungNational Institute of Environmental Health SciencesHjartaverndLungenliga SchweizEuropean CommissionAge UKNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekFreiwillige Akademische GesellschaftJohns Hopkins UniversityNational Health and Medical Research CouncilAstraZenecaDirectorate for Biological SciencesGlaxoSmithKlineChinese Society of Clinical OncologyJuvenile Diabetes Research Foundation InternationalUniversity of EdinburghNational Science Foundation
- Mots-clés
- Genome-wide association studyMedicineSingle-nucleotide polymorphismCOPDMeta-analysisPopulationSpirometryAsthmaGenetic associationGeneticsAirway obstructionInternal medicineGeneGenotypeBiologyAirwaySurgeryEnvironmental health
- Résumé présent dans OpenAlex
- oui