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Enregistrement W2168861511 · doi:10.1111/jipb.12027

Fine Mapping of <i>RppP25</i>, a Southern Rust Resistance Gene in Maize

2013· article· en· W2168861511 sur OpenAlexaff
Panfeng Zhao, Guobin Zhang, Xiaojun Wu, Na Li, Dianyi Shi, Dengfeng Zhang, Chunfang Ji, Mingliang Xu, Shoucai Wang

Notice bibliographique

RevueJournal of Integrative Plant Biology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueWheat and Barley Genetics and Pathology
Établissements canadiensMinistry of Agriculture
Organismes subventionnairesU.S. Department of Agriculture
Mots-clésBiologyGeneticsIndelRust (programming language)GeneCandidate geneInbred strainAllelePucciniaGene mappingQuantitative trait locusDowny mildewPlant disease resistanceGenetic analysisSingle-nucleotide polymorphismChromosomeBotanyGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Southern rust (Puccinia polysora Underw.) is a major disease that can cause severe yield losses in maize (Zea mays L.). In our previous study, a major gene RppP25 that confers resistance to southern rust was identified in inbred line P25. Here, we report the fine mapping and candidate gene analysis of RppP25 from the near-isogenic line F939, which harbors RppP25 in the genetic background of the susceptible inbred line F349. The inheritance of resistance to southern rust was investigated in the BC1 F1 and BC3 F1 populations, which were derived from a cross between F939 and F349 (as the recurrent parent). The 1:1 segregation ratio of resistance to susceptible plants in these two populations indicated that the resistance is controlled by a single dominant gene. Ten markers, including three simple sequence repeat (SSR) markers and seven insertion/deletion (InDel) markers, were developed in the RppP25 region. RppP25 was delimited to an interval between P091 and M271, with an estimated length of 40 kb based on the physical map of B73. In this region, a candidate gene was identified that was predicted to encode a putative nucleotide-binding site leucine-rich repeat (NBS-LRR) protein. Two co-segregated markers will aid in pyramiding diverse southern rust resistance alleles into elite materials, and thereby improve southern rust resistance worldwide.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,638
Score d'incertitude au seuil0,400

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,212
Écart entre enseignants0,193 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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