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Enregistrement W2168958678 · doi:10.1016/j.neuron.2015.10.030

ALS/FTD Mutation-Induced Phase Transition of FUS Liquid Droplets and Reversible Hydrogels into Irreversible Hydrogels Impairs RNP Granule Function

2015· article· en· W2168958678 sur OpenAlexafffund
Tetsuro Murakami, Seema Qamar, Julie Qiaojin Lin, Gabriele S. Kaminski Schierle, Eric J. Rees, Akinori Miyashita, Ana Rita Costa, Roger B. Dodd, Fiona T.S. Chan, Claire H. Michel, Deborah Kronenberg‐Versteeg, Yi Li, Seung‐Pil Yang, Yosuke Wakutani, William Meadows, Rodylyn Rose Ferry, Liang Dong, Gian Gaetano Tartaglia, Giorgio Favrin, Wen-Lang Lin, Dennis W. Dickson, Mei Zhen, David Ron, Gerold Schmitt‐Ulms, Paul E. Fraser, Neil A. Shneider, Christine E. Holt, Michele Vendruscolo, Clemens F. Kaminski, Peter St George‐Hyslop

Notice bibliographique

RevueNeuron · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteMount Sinai HospitalUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeMedical Research CouncilNational Institutes of HealthVersus ArthritisEuropean CommissionEngineering and Physical Sciences Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchAlzheimer SocietyWellcome Trust
Mots-clésStress granuleRibonucleoproteinChemistryNeurotoxicityRNACell biologyNeurodegenerationGranule (geology)BiophysicsSelf-healing hydrogelsRNA-binding proteinTranslation (biology)BiochemistryBiologyMessenger RNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The mechanisms by which mutations in FUS and other RNA binding proteins cause ALS and FTD remain controversial. We propose a model in which low-complexity (LC) domains of FUS drive its physiologically reversible assembly into membrane-free, liquid droplet and hydrogel-like structures. ALS/FTD mutations in LC or non-LC domains induce further phase transition into poorly soluble fibrillar hydrogels distinct from conventional amyloids. These assemblies are necessary and sufficient for neurotoxicity in a C. elegans model of FUS-dependent neurodegeneration. They trap other ribonucleoprotein (RNP) granule components and disrupt RNP granule function. One consequence is impairment of new protein synthesis by cytoplasmic RNP granules in axon terminals, where RNP granules regulate local RNA metabolism and translation. Nuclear FUS granules may be similarly affected. Inhibiting formation of these fibrillar hydrogel assemblies mitigates neurotoxicity and suggests a potential therapeutic strategy that may also be applicable to ALS/FTD associated with mutations in other RNA binding proteins.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,283
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations920
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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