Polygenic Overlap Between Kidney Function and Large Artery Atherosclerotic Stroke
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND AND PURPOSE: Epidemiological studies show strong associations between kidney dysfunction and risk of ischemic stroke (IS), the mechanisms of which are incompletely understood. We investigated whether these associations may reflect shared heritability because of a common polygenic basis and whether this differed for IS subtypes. METHODS: Polygenic models were derived using genome-wide association studies meta-analysis results for 3 kidney traits: estimated glomerular filtration rate using serum creatinine (eGFRcrea: n=73 998), eGFR using cystatin C (eGFRcys: n=22 937), and urinary albumin to creatinine ratio (n=31 580). For each, single nucleotide polymorphisms passing 10 P value thresholds were used to form profile scores in 4561 IS cases and 7094 controls from the United Kingdom, Germany, and Australia. Scores were tested for association with IS and its 3 aetiological subtypes: large artery atherosclerosis, cardioembolism, and small vessel disease. RESULTS: Polygenic scores correlating with higher eGFRcrea were associated with reduced risk of large artery atherosclerosis, with 5 scores reaching P<0.05 (peak P=0.004) and all showing the epidemiologically expected direction of effect. A similar pattern was observed for polygenic scores reflecting higher urinary albumin to creatinine ratio, of which 3 associated with large artery atherosclerosis (peak P=0.01) and all showed the expected directional association. One urinary albumin to creatinine ratio-based score also associated with small vessel disease (P=0.03). The global pattern of results was unlikely to have occurred by chance (P=0.02). CONCLUSIONS: This study suggests possible polygenic correlation between renal dysfunction and IS. The shared genetic components may be specific to stroke subtypes, particularly large artery atherosclerotic stroke. Further study of the genetic relationships between these disorders seems merited.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,005 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».