NMR structure of a KlbA intein precursor from <i>Methanococcus jannaschii</i>
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Certain proteins of unicellular organisms are translated as precursor polypeptides containing inteins (intervening proteins), which are domains capable of performing protein splicing. These domains, in conjunction with a single residue following the intein, catalyze their own excision from the surrounding protein (extein) in a multistep reaction involving the cleavage of two intein-extein peptide bonds and the formation of a new peptide bond that ligates the two exteins to yield the mature protein. We report here the solution NMR structure of a 186-residue precursor of the KlbA intein from Methanococcus jannaschii, comprising the intein together with N- and C-extein segments of 7 and 11 residues, respectively. The intein is shown to adopt a single, well-defined globular domain, representing a HINT (Hedgehog/Intein)-type topology. Fourteen beta-strands are arranged in a complex fold that includes four beta-hairpins and an antiparallel beta-ribbon, and there is one alpha-helix, which is packed against the beta-ribbon, and one turn of 3(10)-helix in the loop between the beta-strands 8 and 9. The two extein segments show increased disorder, and form only minimal nonbonding contacts with the intein domain. Structure-based mutation experiments resulted in a proposal for functional roles of individual residues in the intein catalytic mechanism.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle