Genome-wide transcriptional profiling linked to social class in asthma
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVES: Low socioeconomic status (SES) is one of the most robust social factors associated with disease morbidity, including more severe asthma in childhood. However, our understanding of the biological processes that explain this link is limited. This study tested whether the social environment could get "under the skin" to alter genomic activity in children with asthma. DESIGN AND PARTICIPANTS: Two group design of children with physician diagnosed asthma who came from low or high SES families. OUTCOMES: Genome-wide transcriptional profiles from T lymphocytes of children with asthma. RESULTS: Children with asthma from a low SES background showed overexpression of genes regulating inflammatory processes, including those involved in chemokine activity, stress responses and wound responses, compared with children with asthma from a high SES background. Bioinformatic analysis suggested that decreased activity of cyclic AMP response element binding protein and nuclear factor Y and increased nuclear factor kappaB transcriptional signalling mediated these effects. These pathways are known to regulate catecholamine and inflammatory signalling in immune cells. CONCLUSIONS: This study provides the first evidence in a sample of paediatric patients diagnosed with asthma that the larger social environment can affect processes at the genomic level. Specifically, gene transcription control pathways that regulate inflammation and catecholamine signalling were found to vary by SES in children with asthma. Because these pathways are the primary targets of many asthma medications, these findings suggest that the larger social environment may alter molecular mechanisms that have implications for the efficacy of asthma therapeutics.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle