MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2169050290 · doi:10.1128/aem.69.11.6750-6757.2003

Detection and Identification of <i>Lactobacillus</i> Species in Crops of Broilers of Different Ages by Using PCR-Denaturing Gradient Gel Electrophoresis and Amplified Ribosomal DNA Restriction Analysis

2003· article· en· W2169050290 sur OpenAlexafffund
Le Luo Guan, Karen E. Hagen, Gerald W. Tannock, D.R. Korver, G.M. Fasenko, Gwen E. Allison

Notice bibliographique

RevueApplied and Environmental Microbiology · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueProbiotics and Fermented Foods
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of AlbertaNorth Carolina State University
Mots-clésTemperature gradient gel electrophoresisBiologyRibosomal DNAGel electrophoresisSpecies identificationPolymerase chain reactionDNARibosomal RNALactobacillusIdentification (biology)Bacteria16S ribosomal RNAMolecular biologyMicrobiologyGeneticsBotanyGenePhylogenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The microflora of the crop was investigated throughout the broiler production period (0 to 42 days) using PCR combined with denaturing gradient gel electrophoresis (PCR-DGGE) and selective bacteriological culture of lactobacilli followed by amplified ribosomal DNA restriction analysis (ARDRA). The birds were raised under conditions similar to those used in commercial broiler production. Lactobacilli predominated and attained populations of 10(8) to 10(9) CFU per gram of crop contents. Many of the lactobacilli present in the crop (61.9% of isolates) belonged to species of the Lactobacillus acidophilus group and could not be differentiated by PCR-DGGE. A rapid and simple ARDRA method was developed to distinguish between the members of the L. acidophilus group. HaeIII-ARDRA was used for preliminary identification of isolates in the L. acidophilus group and to identify Lactobacillus reuteri and Lactobacillus salivarius. MseI-ARDRA generated unique patterns for all species of the L. acidophilus group, identifying Lactobacillus crispatus, Lactobacillus johnsonii, and Lactobacillus gallinarum among crop isolates. The results of our study provide comprehensive knowledge of the Lactobacillus microflora in the crops of birds of different ages using nucleic acid-based methods of detection and identification based on current taxonomic criteria.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,347
Score d'incertitude au seuil0,222

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,160
Écart entre enseignants0,154 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations127
Publié2003
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueApplied and Environmental MicrobiologyMême sujetProbiotics and Fermented FoodsTravaux en français237 207