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Enregistrement W2169169103 · doi:10.1093/hmg/ddt620

DNA mismatch repair gene MSH6 implicated in determining age at natural menopause

2013· review· en· W2169169103 sur OpenAlexaff
John R. B. Perry, Yi-Hsiang Hsu, Daniel I. Chasman, Andrew D. Johnson, Cathy E. Elks, Eva Albrecht, Irene L. Andrulis, Jonathan Beesley, Gerald S. Berenson, Sven Bergmann, Stig E. Bojesen, Manjeet K. Bolla, Judith Brown, Julie E. Buring, Harry Campbell, Jenny Chang‐Claude, Georgia Chenevix‐Trench, Tanguy Corre, Fergus J. Couch, Angela Cox, Kamila Czene, Pio D’Adamo, Gail Davies, Ian J. Deary, Joe Dennis, Douglas F. Easton, Ellen G. Engelhardt, Johan G. Eriksson, Tõnu Esko, Peter A. Fasching, Jonine D. Figueroa, Henrik Flyger, Abigail Fraser, Montserrat García‐Closas, Paolo Gasparini, Christian Gieger, Graham G. Giles, Pascal Guénel, Sara Hägg, Per Hall, Caroline Hayward, John L. Hopper, Erik Ingelsson, Sharon L. R. Kardia, Katherine Kasiman, Julia A. Knight, Jari Lahti, Debbie A. Lawlor, Patrik K. E. Magnusson, Sara Margolin, Julie Marsh, Andres Metspalu, Janet E. Olson, Craig E. Pennell, Ozren Polašek, Iffat Rahman, Paul M. Ridker, Antonietta Robino, Igor Rudan, Anja Rudolph, Andres Salumets, Marjanka K. Schmidt, Minouk J. Schoemaker, Erin N. Smith, Jennifer A. Smith, Melissa C. Southey, Doris Stöckl, Anthony J. Swerdlow, Deborah J. Thompson, Thérèse Truong, Sheila Ulivi, Mélanie Waldenberger, Qin Wang, Sarah H. Wild, James F. Wilson, Alan F. Wright, Lina Zgaga, Ken K. Ong, Joanne M. Murabito, David Karasik, Anna Murray

Notice bibliographique

RevueHuman Molecular Genetics · 2013
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGenetic factors in colorectal cancer
Établissements canadiensLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteUniversity of TorontoMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesNational Institute on AgingNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilMedical Research CouncilNational Cancer InstituteCancer Research UKWellcome Trust
Mots-clésMSH6MenopauseDNA repairNatural (archaeology)DNA mismatch repairGeneGeneticsBiologyMedicineBioinformatics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The length of female reproductive lifespan is associated with multiple adverse outcomes, including breast cancer, cardiovascular disease and infertility. The biological processes that govern the timing of the beginning and end of reproductive life are not well understood. Genetic variants are known to contribute to ∼50% of the variation in both age at menarche and menopause, but to date the known genes explain <15% of the genetic component. We have used genome-wide association in a bivariate meta-analysis of both traits to identify genes involved in determining reproductive lifespan. We observed significant genetic correlation between the two traits using genome-wide complex trait analysis. However, we found no robust statistical evidence for individual variants with an effect on both traits. A novel association with age at menopause was detected for a variant rs1800932 in the mismatch repair gene MSH6 (P = 1.9 × 10(-9)), which was also associated with altered expression levels of MSH6 mRNA in multiple tissues. This study contributes to the growing evidence that DNA repair processes play a key role in ovarian ageing and could be an important therapeutic target for infertility.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,968
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,054
Tête enseignante GPT0,353
Écart entre enseignants0,299 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations67
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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