African regional external quality assessment for CD4 T-cell enumeration: Development, outcomes, and performance of laboratories
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: An independent African Regional External Quality Assessment Scheme (AFREQAS) was implemented from Johannesburg. The aim was to establish a network of CD4 laboratories supporting HIV/AIDS anti-retroviral therapy programs and improve the quality of regional CD4 testing with EQA assessment, feedback, remedial action, and technical training. The overall performance from 2002 to 2006 (Trials 1-20) is reported, together with cumulative longitudinal performance of the different CD4 methods used. METHODS: Stabilized blood samples with "normal" and/or "low" CD4 values were shipped over 20 Trials. Data was analyzed for each trial including trimmed mean, standard deviation, and percentage coefficient of variation (%CV); "Residual" and SDI values were also calculated for each participating laboratory for both absolute CD4 counts (CD4abs) and CD4 percentage of lymphocytes values (CD4%/Ly). Standardized individual laboratory SDI values across 20 trials were analyzed according to CD4 method. RESULTS: Average participation was 91.5%. Overall AFREQAS between-laboratory reproducibility (trimmed %CV) was 10.5% and 9.1% for absolute CD4 and CD4%/Ly, respectively. For the respective CD4abs and CD4%/Ly values in the trials where "normal" material was shipped trimmed %CV of 10.9 and 7.3% were noted, and in "low" value shipments %CV of 13.8% and 12.4% were noted. Cumulative absolute CD4 SDI analysis revealed the best between-laboratory precision amongst FACSCount and PanLeucogating (PLG-CD4) users (both SD of SDI = <1.2 and %CV of <<8%). Dual Platform or Single Platform algorithm-based systems and certain volumetric methods (laboratories who used Partec CyFlow instruments) had higher numbers of outlying laboratories (>12-25%CV and SD(SDI) > 2.2 noted), indicating that additional technical training and/or manufacturer support was required. CONCLUSIONS: Participation in an AFREQAS with feedback and remedial action improves the quality of CD4 testing. African laboratory professionals can easily master CD4 counting technologies. However, the introduction of the simplest and most cost-effective methodologies is required to take ownership, and enable the delivery of quality CD4 counts in vast numbers necessary to support expansion of African ART programs.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,072 | 0,052 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,003 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,004 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».