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Enregistrement W2169198329 · doi:10.1126/science.1085953

The Genome Sequence of the SARS-Associated Coronavirus

2003· article· en· W2169198329 sur OpenAlexaff
Marco A. Marra, Steven J.M. Jones, Caroline R. Astell, Robert A. Holt, Angela Brooks‐Wilson, Yaron S.N. Butterfield, Jaswinder Khattra, Jennifer Asano, Sarah Barber, Susanna Chan, Alison Cloutier, Shaun Coughlin, Doug Freeman, Noreen Girn, Obi L. Griffith, Stephen Leach, Michael Mayo, Helen McDonald, Stephen B. Montgomery, Pawan Pandoh, Anca S. Petrescu, A. Gordon Robertson, Jacqueline E. Schein, Asim Siddiqui, Duane E. Smailus, Jeff Stott, George Yang, Francis A. Plummer, Anton Andonov, Harvey Artsob, Nathalie Bastien, Kathy Bernard, Timothy F. Booth, Donnie Bowness, Martin Czub, Michael Drebot, Lisa Fernando, Ramon Flick, Michael Garbutt, Michael A. Gray, Allen Grolla, Heinz Feldmann, Adrienne F. A. Meyers, Amin Kabani, Yan Li, Susan Normand, Ute Ströher, Graham Tipples, Shaun Tyler, Robert Vogrig, Diane McVey Ward, Brynn Watson, Robert C. Brunham, Mel Krajden, Martin Petric, Danuta M. Skowronski, Chris Upton, Rachel L. Roper

Notice bibliographique

RevueScience · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueAnimal Virus Infections Studies
Établissements canadiensCanadian Science Centre for Human and Animal HealthUniversity of VictoriaBC Centre for Disease ControlBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésVirologyBiologyCoronavirusGenomeVirusPhylogenetic treeWhole genome sequencingPolymerase chain reactionCoronaviridaeGeneSequence analysisGeneticsCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Infectious disease (medical specialty)MedicineDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We sequenced the 29,751-base genome of the severe acute respiratory syndrome (SARS)-associated coronavirus known as the Tor2 isolate. The genome sequence reveals that this coronavirus is only moderately related to other known coronaviruses, including two human coronaviruses, HCoV-OC43 and HCoV-229E. Phylogenetic analysis of the predicted viral proteins indicates that the virus does not closely resemble any of the three previously known groups of coronaviruses. The genome sequence will aid in the diagnosis of SARS virus infection in humans and potential animal hosts (using polymerase chain reaction and immunological tests), in the development of antivirals (including neutralizing antibodies), and in the identification of putative epitopes for vaccine development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,080
Tête enseignante GPT0,282
Écart entre enseignants0,203 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2 088
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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