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Enregistrement W2169295445 · doi:10.1111/bij.12200

Intercontinental genetic structure in the amphi-Pacific peatmoss<i>Sphagnum miyabeanum</i>(Bryophyta: Sphagnaceae)

2013· article· en· W2169295445 sur OpenAlexaffabout
A. Jonathan Shaw, G. Karen Golinski, Elizabeth Clark, Blanka Shaw, Hans K. Stenøien, Kjell Ivar Flatberg

Notice bibliographique

RevueBiological Journal of the Linnean Society · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueBryophyte Studies and Records
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Science Foundation
Mots-clésBiologyBiological dispersalMossEcologyGenetic structureIsolation by distancePopulationRange (aeronautics)BryophyteSporophyteBiogeographyBotanyGenetic variationDemography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Unlike seed plants where global biogeographical patterns typically involve interspecific phylogenetic history, spore-producing bryophyte species often have intercontinental distributions that are best understood from a population genetic perspective. We sought to understand how reproductive processes, especially dispersal, have contributed to the intercontinental ‘Pacific Rim’ distribution of Sphagnum miyabeanum. In total, 295 gametophyte plants from western North America (California, Oregon, British Columbia, Alaska), Russia, Japan, and China were genotyped at 12 microsatellite loci. Nucleotide sequences were obtained for seven anonymous nuclear loci plus two plastid regions from 21 plants of S. miyabeanum and two outgroup species. We detected weak but significant genetic differentiation among plants from China, Japan, Alaska, British Columbia, and the western USA. Alaskan plants are genetically most similar to Asian plants, and British Columbian plants are most similar to those in the western USA. There is detectable migration between regions, with especially high levels between Alaska and Asia (China and Japan). Migration appears to be recent and/or ongoing, and more or less equivalent in both directions. There is weak (but significant) isolation-by-distance within geographical regions, and the slope of the regression of genetic on geographical distance differs for Asian versus North American plants. A distinctive Vancouver Island morphotype is very weakly differentiated, and does not appear to be reproductively isolated from plants of the normal morphotype. The intercontinental geographical range of S. miyabeanum reflects recent and probably ongoing migration, facilitated by the production of tiny spores capable of effective long distance dispersal. The results of the present study are consistent with Pleistocene survival of S. miyabeanum in unglaciated Beringia, although we cannot eliminate the possibility that the species recolonized Alaska from Asia more recently.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,021

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,180
Écart entre enseignants0,170 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations41
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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