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Enregistrement W2169323621 · doi:10.1371/journal.pgen.1000482

MSH2 ATPase Domain Mutation Affects CTG•CAG Repeat Instability in Transgenic Mice

2009· article· en· W2169323621 sur OpenAlexaff
Stéphanie Tomé, Ian Holt, Winfried Edelmann, Glenn E. Morris, Arnold Münnich, Christopher E. Pearson, Geneviève Gourdon

Notice bibliographique

RevuePLoS Genetics · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueGenetic Neurodegenerative Diseases
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenSickKids FoundationUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleMuscular Dystrophy Association
Mots-clésMSH2BiologyDNA mismatch repairMutationTrinucleotide repeat expansionGeneticsCell biologyMyotonic dystrophyMolecular biologyDNA repairDNAGeneAllele

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Myotonic dystrophy type 1 (DM1) is associated with one of the most highly unstable CTG*CAG repeat expansions. The formation of further repeat expansions in transgenic mice carrying expanded CTG*CAG tracts requires the mismatch repair (MMR) proteins MSH2 and MSH3, forming the MutSbeta complex. It has been proposed that binding of MutSbeta to CAG hairpins blocks its ATPase activity compromising hairpin repair, thereby causing expansions. This would suggest that binding, but not ATP hydrolysis, by MutSbeta is critical for trinucleotide expansions. However, it is unknown if the MSH2 ATPase activity is dispensible for instability. To get insight into the mechanism by which MSH2 generates trinucleotide expansions, we crossed DM1 transgenic mice carrying a highly unstable >(CTG)(300) repeat tract with mice carrying the G674A mutation in the MSH2 ATPase domain. This mutation impairs MSH2 ATPase activity and ablates base-base MMR, but does not affect the ability of MSH2 (associated with MSH6) to bind DNA mismatches. We found that the ATPase domain mutation of MSH2 strongly affects the formation of CTG expansions and leads instead to transmitted contractions, similar to a Msh2-null or Msh3-null deficiency. While a decrease in MSH2 protein level was observed in tissues from Msh2(G674) mice, the dramatic reduction of expansions suggests that the expansion-biased trinucleotide repeat instability requires a functional MSH2 ATPase domain and probably a functional MMR system.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,022
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations100
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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