Smoking behaviour modifies <i>IL23r</i>‐associated disease risk in patients with Crohn's disease
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND AND AIM: The etiology of Crohn's disease (CD) implicates both genetic and environmental factors. Smoking behavior is one environmental risk factor to play a role in the development of CD. The study aimed to assess the contribution of the interleukin 23 receptor (IL23R) in determining disease susceptibility in two independent cohorts of CD, and to investigate the interactions between IL23R variants, smoking behavior, and CD-associated genes, NOD2 and ATG16L1. METHODS: Ten IL23R single-nucleotide polymorphisms (SNPs) were genotyped in 675 CD cases, and 1255 controls from Brisbane, Australia (dataset 1). Six of these SNPs were genotyped in 318 CD cases and 533 controls from Canterbury, New Zealand (dataset 2). Case-control analysis of genotype and allele frequencies, and haplotype analysis for all SNPs was conducted. RESULTS: We demonstrate a strong increased CD risk for smokers in both datasets (odds ratio 3.77, 95% confidence interval 2.88-4.94), and an additive interaction between IL23R SNPs and cigarette smoking. Ileal involvement was a consistent marker of strong SNP-CD association (P ≤ 0.001), while the lowest minor allele frequencies for location were found in those with colonic CD (L2). Three haplotype blocks were identified across the 10 IL23R SNPs conferring different risk of CD. Haplotypes conferred no further risk of CD when compared with single SNP analyses. CONCLUSION: IL23R gene variants determine CD susceptibility in the Australian and New Zealand population, particularly ileal CD. A strong additive interaction exists between IL23R SNPs and smoking behavior resulting in a dramatic increase in disease risk depending upon specific genetic background.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».