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Enregistrement W2169462897 · doi:10.1158/1055-9965.epi-04-0612

Gene-Smoking Interaction Associations for the <i>ERCC1</i> Polymorphisms in the Risk of Lung Cancer

2005· article· en· W2169462897 sur OpenAlexaff
Wei Zhou, Geoffrey Liu, Sohee Park, Zhaoxi Wang, John C. Wain, Thomas J. Lynch, Su Li, David C. Christiani

Notice bibliographique

RevueCancer Epidemiology Biomarkers & Prevention · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA Repair Mechanisms
Établissements canadiensImmunovaccine (Canada)
Organismes subventionnairesNational Institute of Environmental Health SciencesNational Cancer InstituteMassachusetts General Hospital
Mots-clésERCC1Lung cancerOdds ratioNucleotide excision repairLinkage disequilibriumInternal medicineConfidence intervalOncologySingle-nucleotide polymorphismMedicineGenotypeDNA repairGastroenterologyBiologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cigarette smoking may induce DNA damage. Lower DNA repair capacities have been associated with higher risk of lung cancer. Excision repair cross-complementing group 1 (ERCC1) is the lead enzyme in the nucleotide excision repair process, and low expression of ERCC1 mRNA levels has been associated with higher risk of cancers. We examined the association between two polymorphisms of ERCC1, 8092C > A (rs3212986) and 19007T > C (codon 118, rs11615), which are associated with altered ERCC1 mRNA stability and mRNA levels, in 1,752 Caucasian lung cancer patients and 1,358 controls. The results were analyzed using logistic regression models, adjusting for relevant covariates. The two polymorphisms were in Hardy-Weinberg disequilibrium and in linkage disequilibrium. There was no overall association between ERCC1 polymorphisms and lung cancer risk, with the adjusted odds ratios (AOR) of 1.26 [95% confidence interval (95% CI), 0.81-1.96] for the 8092C > A polymorphism (A/A versus C/C) and 0.93 (95% CI, 0.67-1.30) for the 19007T > C polymorphism (C/C versus T/T). Stratified analyses revealed that the AORs for the 8092C > A polymorphism (A/A versus C/C) decreased significantly as pack-years increased, with the AOR of 2.11 (95% CI, 1.03-4.31) in never smokers and 0.50 (95% CI, 0.25-1.01) in heavy smokers (>/=56 pack-years), respectively. Consistent results were found when gene-smoking interaction was incorporated by joint effects and interactions models that considered both discrete and continuous variables for cumulative smoking exposure. The same direction for the gene-smoking interaction was found for the 19007T > C polymorphism, although the interaction was not statistically significant. In conclusion, ERCC1 8092C > A polymorphism may modify the associations between cumulative cigarette smoking and lung cancer risk.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,116
Score d'incertitude au seuil0,443

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,361
Écart entre enseignants0,329 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations93
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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