Amplification and Overexpression of <i>CACNA1E</i> Correlates with Relapse in Favorable Histology Wilms' Tumors
Notice bibliographique
Résumé
PURPOSE: The most well established molecular markers of poor outcome in Wilms' tumor are loss of heterozygosity at chromosomes 1p and/or 16q, although to date no specific genes at these loci have been identified. We have previously shown a link between genomic gain of chromosome 1q and tumor relapse and sought to further elucidate the role of genes on 1q in treatment failure. EXPERIMENTAL DESIGN: Microarray-based comparative genomic hybridization identified a microamplification harboring a single gene (CACNA1E) at 1q25.3 in 6 of 76 (7.9%) Wilms' tumors, correlating with a shorter relapse-free survival (P = 0.0044, log-rank test). Further characterization of this gene was carried out by measuring mRNA and protein expression as well as stable transfection of HEK293 cells. RESULTS: Overexpression of the CACNA1E transcript was associated with DNA copy number (P = 0.0204, ANOVA) and tumor relapse (P = 0.0851, log-rank test). Immunohistochemistry against the protein product Ca(V)2.3 revealed expression localized to the apical membrane in the distal tubules of normal kidney but not to the metanephric blastemal cells of fetal kidney from which Wilms' tumors arise. Nuclear localization in 99 of 160 (61.9%) Wilms' tumor cases correlated with a reduced relapse-free survival, particularly in cases treated with preoperative chemotherapy (P = 0.009, log-rank test). Expression profiling of stably transfected HEK293 cells revealed specific up-regulation of the immediate early response genes EGR1/EGR2/EGR3 and FOS/FOSB, mediated by activation of the MEK/ERK5/Nur77 pathway. CONCLUSIONS: These data identify a unique genetic aberration with direct clinical relevance in Wilms' tumor relapse and provide evidence for a potential novel mechanism of treatment resistance in these tumors.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».