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Enregistrement W2169536980 · doi:10.1164/rccm.201304-0732oc

Autophagy in Locomotor Muscles of Patients with Chronic Obstructive Pulmonary Disease

2013· article· en· W2169536980 sur OpenAlexafffund
Yeting Guo, Harry R. Gosker, Annemie M.W.J. Schols, Sophia Kapchinsky, Jean Bourbeau, Marco Sandri, R. Thomas Jagoe, Richard Debigaré, François Maltais, Tanja Taivassalo, Sabah N. A. Hussain

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Respiratory and Critical Care Medicine · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAutophagy in Disease and Therapy
Établissements canadiensUniversité LavalChristie (Canada)McGill UniversityJewish General HospitalMcGill University Health CentreInstitut universitaire de cardiologie et de pneumologie de Québec
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchHelsingin Yliopisto
Mots-clésAutophagyAMPKMedicineATG12mTORC1BECN1Protein degradationProtein kinase BFOXO3EndocrinologyInternal medicineCell biologyBiologyProtein kinase ASignal transductionPhosphorylationATG5Biochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

RATIONALE: Locomotor muscle atrophy develops in patients with chronic obstructive pulmonary disease (COPD) partly because of increased protein degradation by the ubiquitin-proteasome system. It is not known if autophagy also contributes to protein degradation. OBJECTIVES: To investigate whether autophagy is enhanced in locomotor muscles of stable patients with COPD, to quantify autophagy-related gene expression in these muscles, and to identify mechanisms of autophagy induction. METHODS: Muscle biopsies were obtained from two cohorts of control subjects and patients with COPD and the numbers of autophagosomes in the vastus lateralis and tibialis anterior muscles, the levels of LC3B protein lipidation, and the expression of autophagy-related genes were measured in the vastus lateralis muscle. To investigate potential pathways that might induce the activation of autophagy, measures were taken of protein kinase B (AKT), mTORC1, and AMPK pathway activation, transcription factor regulation, proteasome activation, and oxidative stress. MEASUREMENTS AND MAIN RESULTS: Autophagy is enhanced in the locomotor muscles of patients with COPD as shown by significantly higher numbers of autophagosomes in affected muscles as compared with control subjects. Autophagosome number inversely correlates with FEV1. In the vastus lateralis, LC3B protein lipidation is increased by COPD and the expression of autophagy-related gene expressions is up-regulated. LC3B lipidation inversely correlates with thigh cross-sectional area, FEV1, and FEV1/FVC ratio. Enhanced autophagy is associated with activation of the AMPK pathway and FOXO transcription factors, inhibition of the mTORC1 and AKT pathways, and the development of oxidative stress. CONCLUSIONS: Autophagy is significantly enhanced in locomotor muscles of stable patients with COPD. The degree of autophagy correlates with severity of muscle atrophy and lung function impairment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations114
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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