Molecular and morphological variation within swim bladder nematodes, <i>Cystidicola</i> spp.
Notice bibliographique
Résumé
We sequenced four rDNA regions (ITS-1, ITS-2, 5.8S, and D3 region of 28S) from the parasitic nematode Cystidicola spp. from seven species of fish host and 11 locations in Canada and Finland to elucidate suspected unresolved genetic variation within the genus. A holarctic species, Cystidicola farionis from the swim bladder of Salmonidae and Osmeridae, and a nearctic species, Cystidicola stigmatura from trout and char (Salvelinus spp.), differ in life history, host and geographic range, reproductive strategy, and adult and egg morphology. These nematodes were identical at three rDNA regions (ITS-1, 5.8S, and D3); however, two ITS-2 variants were found that differed at four nucleotide positions: variant I (366 bp) was found in British Columbia populations of C. farionis and in C. stigmatura and variant II (369 bp) was found in Ontario and Finnish populations of C. farionis. These results demonstrate that two species with distinct morphology and biology can have identical rDNA sequences, while two morphologically identical isolates have different ITS-2 sequences. Thus, rDNA spacer regions may not be useful for distinguishing biologically valid species or subspecies in some nematode groups. Although phenotypic variation suggested a third undescribed species of Cystidicola from lake whitefish (Coregonus clupeaformis), rDNA analysis did not provide meaningful evidence of its uniqueness.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».