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Enregistrement W2169591862 · doi:10.1074/jbc.m510792200

Probing the Adhesive Footprints of Mytilus californianus Byssus

2006· article· en· W2169591862 sur OpenAlexaboutno aff
Hua Zhao, Nicholas Robertson, Scott A. Jewhurst, J. Herbert Waite

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueMarine Biology and Environmental Chemistry
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Dental and Craniofacial Research
Mots-clésByssusMytilusExtracellular matrixComplementary DNAHoldfastMolecular massChemistryMolecular biologyBiochemistryBiophysicsBiologyAnatomyGeneEnzymeBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

California mussels Mytilus californianus owe their tenacity to a holdfast known as the byssus, a fibrous extracellular structure that ends distally in flattened adhesive plaques. The "footprints" of freshly secreted plaques deposited onto glass coverslips were shown by matrix-assisted laser desorption ionization time of flight mass spectrometry to consist chiefly of proteins ranging in mass from 5200 to 6700 Da. These proteins, variants of a family known as mcfp3 (M. californianus foot protein 3), were purified from acetic acid/urea extracts of plaques and foot tissue. Mcfp3 appears to sort into fast and slow electrophoretic variants. Both are rich in Gly and Asn and exhibit post-translational hydroxylation of Tyr and Arg to Dopa and 4-hydroxyarginine, respectively, with the fast variant containing more than twice as much Lys + Arg. Both the slow and fast variants were partially sequenced from the N terminus, and the complete sequences of 12 variants were deduced from cDNA using degenerate oligonucleotides, PCR, and rapid amplification of cDNA ends. Mcfp3s are highly polar molecules and contain up to 28 mol % Dopa, which remains intact and may be crucial for adhesion to metal and mineral surfaces.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,182
Écart entre enseignants0,173 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations158
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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