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Enregistrement W2169611289 · doi:10.1139/x04-183

Early genetic testing of coastal Douglas-fir for Swiss needle cast tolerance

2005· article· en· W2169611289 sur OpenAlexvenueno aff
Fatih Temel, Greg Johnson, W. T. Adams

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Forest Research · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Pathogens and Fungal Diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesU.S. Forest ServiceOregon State University
Mots-clésSeedlingBiologyDouglas firHorticultureBotanyHeritabilityGenetic variationTree breedingInoculationWoody plantGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The possibility of early testing coastal Douglas-fir (Pseudotsuga menziesii var. menziesii (Mirb.) Franco) for Swiss needle cast (SNC; caused by Phaeocryptopus gaeumannii (Rohde) Petrak) tolerance was investigated using 55 Douglas-fir families from western Oregon. Seedlings were inoculated with P. gaeumannii naturally in the field and were visually scored for a variety of SNC symptom traits (i.e., needle and foliage color, and retention) at the seedling stage (age 2) and in "mature" (ages 10 and 12) trees at two test sites for both the seedling and mature ages. Seedlings were also assessed in the laboratory for SNC symptom traits, for proportion of needle stomata occluded with pseudothecia (PSOP), and for amount of P. gaeumannii DNA in needles. Although families differed significantly at both ages for all SNC symptom traits and for PSOP, they did not differ for amount of fungal DNA. Thus, genetic variation in SNC symptoms appears to be primarily due to differences in tolerance to the disease rather than to resistance to infection per se. Estimated individual-tree heritabilities for SNC symptom traits were low to moderate (mean hi2 = 0.19, range 0.06–0.37) at both ages, and within each age-class these traits were moderately to strongly genetically correlated (mean rA = 0.69, range 0.42–0.95). Type B genetic correlations between SNC symptom traits in seedlings and mature trees ranged from 0 to 0.83 and were weakest for traits measured in the laboratory. Genetic gain estimates indicated that family selection for SNC tolerance (i.e., greener needles or greater foliage retention) at the seedling stage can be very effective in increasing tolerance in older trees.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,294
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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