MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2169730497 · doi:10.1074/mcp.m500255-mcp200

Characterization of an RNA Granule from Developing Brain

2005· article· en· W2169730497 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueMolecular & Cellular Proteomics · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and HospitalUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRNAComputational biologyGranule (geology)ChemistryBiologyBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In brain, mRNAs are transported from the cell body to the processes, allowing for local protein translation at sites distant from the nucleus. Using subcellular fractionation, we isolated a fraction from rat embryonic day 18 brains enriched for structures that resemble amorphous collections of ribosomes. This fraction was enriched for the mRNA encoding beta-actin, an mRNA that is transported in dendrites and axons of developing neurons. Abundant protein components of this fraction, determined by tandem mass spectrometry, include ribosomal proteins, RNA-binding proteins, microtubule-associated proteins (including the motor protein dynein), and several proteins described only as potential open reading frames. The conjunction of RNA-binding proteins, transported mRNA, ribosomal machinery, and transporting motor proteins defines these structures as RNA granules. Expression of a subset of the identified proteins in cultured hippocampal neurons confirmed that proteins identified in the proteomics were present in neurites associated with ribosomes and mRNAs. Moreover many of the expressed proteins co-localized together. Time lapse video microscopy indicated that complexes containing one of these proteins, the DEAD box 3 helicase, migrated in dendrites of hippocampal neurons at the same speed as that reported for RNA granules. Although the speed of the granules was unchanged by activity or the neurotrophin brain-derived neurotrophic factor, brain-derived neurotrophic factor, but not activity, increased the proportion of moving granules. These studies define the isolation and composition of RNA granules expressed in developing brain.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,114
Score d'incertitude au seuil0,722

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle