tRNA <sup>His</sup> maturation: An essential yeast protein catalyzes addition of a guanine nucleotide to the 5′ end of tRNA <sup>His</sup>
Notice bibliographique
Résumé
All tRNAHis molecules are unusual in having an extra 5' GMP residue (G(-1)) that, in eukaryotes, is added after transcription and RNase P cleavage. Incorporation of this G(-1) residue is a rare example of nucleotide addition occurring at an RNA 5' end in a normal phosphodiester linkage. We show here that the essential Saccharomyces cerevisiae ORF YGR024c (THG1) is responsible for this guanylyltransferase reaction. Thg1p was identified by survey of a genomic collection of yeast GST-ORF fusion proteins for addition of [alpha-32P]GTP to tRNAHis. End analysis confirms the presence of G(-1). Thg1p is required for tRNAHis guanylylation in vivo, because cells depleted of Thg1p lack G(-1) in their tRNAHis. His6-Thg1p purified from Escherichia coli catalyzes the guanylyltransferase step of G(-1) addition using a ppp-tRNAHis substrate, and appears to catalyze the activation step using p-tRNAHis and ATP. Thg1p is highlye conserved in eukaryotes, where G(-1) addition is necessary, and is not found in eubacteria, where G(-1) is genome-encoded. Thus, Thg1p is the first member of a new family of enzymes that can catalyze phosphodiester bond formation at the 5' end of RNAs, formally in a 3'-5' direction. Surprisingly, despite its varied activities, Thg1p contains no recognizable catalytic or functional domains.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».