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Enregistrement W2169740355 · doi:10.1002/gcc.10181

Characterization of the recurrent translocation t(1;1)(p36.3;q21.1–2) in non‐Hodgkin lymphoma by multicolor banding and fluorescence in situ hybridization analysis

2003· article· en· W2169740355 sur OpenAlexaff
Valia S. Lestou, Olga Ludkovski, Joseph M. Connors, Randy D. Gascoyne, Wan L. Lam, Douglas E. Horsman

Notice bibliographique

RevueGenes Chromosomes and Cancer · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLymphoma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesNational Cancer Institute
Mots-clésChromosomal translocationDicentric chromosomeFluorescence in situ hybridizationBreakpointGene duplicationBiologyLocus (genetics)Molecular biologyGeneticsKaryotypeBacterial artificial chromosomeComparative genomic hybridizationChromosomal rearrangementChromosomeCytogeneticsGeneGenome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Aberrations of chromosomal bands 1p36 and 1q11-q23 are among the most common chromosomal alterations in non-Hodgkin lymphoma (NHL). In this study, 16 cases of NHL showing recurrent unbalanced translocation t(1;1)(p36;q11-23) by G-band analysis were selected for further analysis. To delineate the exact breakpoints, multicolor band analysis for chromosome 1 (M-BAND1), and locus-specific fluorescence in situ hybridization (LS-FISH) using human genome designated BAC clones were performed. In all but one dicentric case, the breakpoint was determined to involve chromosomal bands 1p36.3 and 1q21.1-2. LS-FISH analysis for the TP73, MEL1, SKI, and CASP9 loci at 1p36, and the loci IRTA1, IRTA2, BCL9, AF1Q, JTB, and MUC1 at 1q21, verified the MBAND1 results and further delineated the breakpoints. In band 1p36, two hybridization patterns were observed, one involving deletions of MEL1, TP73, and SKI, but not CASP9, and the second involving a breakpoint telomeric to TP73. In region 1q21, four hybridization patterns were observed, the first involving duplication/translocation of all five genes; the second involving duplication/translocation of BCL9, AF1Q, JTB, and MUC1; the third involving duplication/translocation of AF1Q, JTB, and MUC1; and the fourth with a breakpoint telomeric to MUC1. Using an alpha-satellite probe for chromosome 1 (D1Z5), centromeric involvement in the unbalanced translocation t(1;1)(p36.3;q21.1-2) was excluded in all but the one dicentric case, that is, dic(1;1)(p36.3;q10). In conclusion, deletion of 1p36 and duplication of 1q21 through formation of an unbalanced translocation t(1;1)(p36.3;q21.1-2) is a non-random event in NHL, suggesting a deletion-duplication mechanism involved in lymphoma progression and justifying further systematic research.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,136
Score d'incertitude au seuil0,331

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations30
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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