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Enregistrement W2169748580 · doi:10.3201/eid1507.090043

Frequency and Evolution of Azole Resistance in<i>Aspergillus fumigatus</i>Associated with Treatment Failure1

2009· article· en· W2169748580 sur OpenAlexaff
Susan J. Howard, Daša Cerar, Michael J. Anderson, Ahmed Albarrag, Matthew C. Fisher, Alessandro C. Pasqualotto, Michél Laverdière, Maiken Cavling Arendrup, David S. Perlin, David W. Denning

Notice bibliographique

RevueEmerging infectious diseases · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntifungal resistance and susceptibility
Établissements canadiensHôpital Maisonneuve-Rosemont
Organismes subventionnairesUniversity of ManchesterUniversity of Warwick
Mots-clésPosaconazoleItraconazoleAspergillus fumigatusVoriconazoleAzoleMicrobiologyAspergillosisDrug resistanceBiologyPopulationAspergillusMedicineAntifungalImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Azoles are the mainstay of oral therapy for aspergillosis. Azole resistance in Aspergillus has been reported infrequently. The first resistant isolate was detected in 1999 in Manchester, UK. In a clinical collection of 519 A. fumigatus isolates, the frequency of itraconazole resistance was 5%, a significant increase since 2004 (p<0.001). Of the 34 itraconazole-resistant isolates we studied, 65% (22) were cross-resistant to voriconazole and 74% (25) were cross-resistant to posaconazole. Thirteen of 14 evaluable patients in our study had prior azole exposure; 8 infections failed therapy (progressed), and 5 failed to improve (remained stable). Eighteen amino acid alterations were found in the target enzyme, Cyp51A, 4 of which were novel. A population genetic analysis of microsatellites showed the existence of resistant mutants that evolved from originally susceptible strains, different cyp51A mutations in the same strain, and microalterations in microsatellite repeat number. Azole resistance in A. fumigatus is an emerging problem and may develop during azole therapy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations749
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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