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Enregistrement W2169753995 · doi:10.1128/jcm.38.1.375-381.2000

Pulmonary Infection Caused by <i>Gymnascella hyalinospora</i> in a Patient with Acute Myelogenous Leukemia

2000· article· en· W2169753995 sur OpenAlexaff
Peter C. Iwen, Lynne Sigler, Stefano Tarantolo, Deanna A. Sutton, Michael G. Rinaldi, Rudy P. Lackner, Dora I. McCarthy, Steven H. Hinrichs

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Microbiology · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntifungal resistance and susceptibility
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLeukemiaBiologyItraconazoleFluconazolePathologyBiopsyAmphotericin BPancytopeniaMedicineMicrobiologyImmunologyAntifungalBone marrow

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We report the first case of invasive pulmonary infection caused by the thermotolerant ascomycetous fungus Gymnascella hyalinospora in a 43-year-old female from the rural midwestern United States. The patient was diagnosed with acute myelogenous leukemia and treated with induction chemotherapy. She was discharged in stable condition with an absolute neutrophil count of 100 cells per microliter. Four days after discharge, she presented to the Cancer Clinic with fever and pancytopenia. A solitary pulmonary nodule was found in the right middle lobe which was resected by video-assisted thoracoscopy (VATHS). Histopathological examination revealed septate branching hyphae, suggesting a diagnosis of invasive aspergillosis; however, occasional yeast-like cells were also present. The culture grew a mold that appeared dull white with a slight brownish tint that failed to sporulate on standard media. The mold was found to be positive by the AccuProbe Blastomyces dermatitidis Culture ID Test (Gen-Probe Inc., San Diego, Calif.), but this result appeared to be incompatible with the morphology of the structures in tissue. The patient was removed from consideration for stem cell transplant and was treated for 6 weeks with amphotericin B (AmB), followed by itraconazole (Itr). A VATHS with biopsy performed 6 months later showed no evidence of mold infection. In vitro, the isolate appeared to be susceptible to AmB and resistant to fluconazole and 5-fluorocytosine. Results for Itr could not be obtained for the case isolate due to its failure to grow in polyethylene glycol used to solubilize the drug; however, MICs for a second isolate appeared to be elevated. The case isolate was subsequently identified as G. hyalinospora based on its formation of oblate, smooth-walled ascospores within yellow or yellow-green tufts of aerial hyphae on sporulation media. Repeat testing with the Blastomyces probe demonstrated false-positive results with the case isolate and a reference isolate of G. hyalinospora. This case demonstrates that both histopathologic and cultural features should be considered for the proper interpretation of this molecular test and extends the list of fungi recognized as a cause of human mycosis in immunocompromised patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: Étude de cas
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,309
Écart entre enseignants0,293 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations35
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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