Identification and Characterization of <i>fhuD1</i> and <i>fhuD2</i> , Two Genes Involved in Iron-Hydroxamate Uptake in <i>Staphylococcus aureus</i>
Notice bibliographique
Résumé
Staphylococcus aureus can utilize several hydroxamate siderophores for growth under iron-restricted conditions. Previous findings have shown that S. aureus possesses a cytoplasmic membrane-associated traffic ATPase that is involved in the specific transport of iron(III)-hydroxamate complexes. In this study, we have identified two additional genes, termed fhuD1 and fhuD2, whose products are involved in this transport process in S. aureus. We have shown that fhuD2 codes for a posttranslationally modified lipoprotein that is anchored in the cytoplasmic membrane, while the deduced amino acid sequence predicts the same for fhuD1. The predicted FhuD1 and FhuD2 proteins share 41.0% identity and 56.4% total similarity with each other, 45.9 and 49.1% total similarity with the FhuD homolog in Bacillus subtilis, and 29.3 and 24.6% total similarity with the periplasmic FhuD protein from Escherichia coli. Insertional inactivation and gene replacement of both genes showed that while FhuD2 is involved in the transport of iron(III) in complex with ferrichrome, ferrioxamine B, aerobactin, and coprogen, FhuD1 shows a more limited substrate range, capable of only iron(III)-ferrichrome and iron(III)-ferrioxamine B transport in S. aureus. Nucleotide sequences present upstream of both fhuD1 and fhuD2 predict the presence of consensus Fur binding sequences. In agreement, transcription of both genes was negatively regulated by exogenous iron levels through the activity of the S. aureus Fur protein.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».