Microheterogeneity and Coevolution: An Examination of rDNA Sequence Characteristics in <i>Neoparamoeba pemaquidensis</i> and Its Prokinetoplastid Endosymbiont
Notice bibliographique
Résumé
Neoparamoeba pemaquidensis, the etiological agent of amoebic gill disease, has shown surprising sequence variability among different copies of the 18S ribosomal RNA gene within an isolate. This intra-genomic microheterogeneity was confirmed and extended to an analysis of the internal transcribed spacer (ITS) region. High levels of intra-genomic nucleotide diversity (Pi=0.0201-0.0313) were found among sequenced ITS regions from individual host amoeba isolates. In contrast, the ITS region of its endosymbiont revealed significantly lower levels of intra-genomic nucleotide diversity (Pi=0.0028-0.0056) compared with the host N. pemaquidensis. Phylogenetic and ParaFit coevolution analyses involving N. pemaquidensis isolates and their respective endosymbionts confirmed a significant coevolutionary relationship between the two protists. The observation of non-shared microheterogeneity and coevolution emphasizes the complexity of the interactions between N. pemaquidensis and its obligate endosymbiont.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».