Immunofluorescence Assay and PCR Analysis of Cryptosporidium Oocysts and Species From Human Fcal Specimens
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Cryptosporidium spp. is a widespread protozoan parasite involving humans and animals. OBJECTIVES: This study was carried out to evaluate the immunofluorescence assay (IFA) and PCR results for more accurate diagnosis of faecal specimens. PATIENTS AND METHODS: Forty six faecal human specimens of Cryptosporidium oocysts were examined by PCR and IFA in Calgary, Canada. In statistical analysis, sensitivity and positive predictive value were detected by IFA. RESULTS: Among 46 faecal samples, 9 (19.6%) were IFA-positive and 10 (21.7%) PCR-positive. Faecal smears of both PCR- and IFA-positive shown that the reproducibility was 90.9% for PCR-DNA and 81.8% for IFA. In Our findings, PCR -DNA showed that diagnosis cryptosporidiosis 2.1% was more sensitive than IFA. Two different oocysts sizes were visualized by IF microscopy which belonged to different species. Furthermore, PCR analysis with primers against the 18S rRNA gene indicated two genotypes of C. hominis and C. parvum, 500-650 base pairs (bp). In this study, the golden standard was the PCR. In statistical analyses, IFA had positive predictive value (PPV) of 81.8% with 81.8% sensitivity, whereas negative predictive value (NPV) was 1% with 0.97% specificity. CONCLUSIONS: PCR showed more sensitivity than IFA for tracking Cryptosporidium oocysts as well as detection of species in faecal human specimens.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».