Examination of nuclear loci across a zone of mitochondrial introgression between Tamias ruficaudus and T. amoenus
Notice bibliographique
Résumé
The importance of hybridization in animal evolution has become controversial. Gene flow between divergent taxa can strongly influence processes of great interest to evolutionary biologists, such as speciation and adaptation. Mitochondrial DNA (mtDNA) introgression is a commonly observed, yet particularly poorly understood consequence of hybridization between divergent taxa. Several known cases of mtDNA introgression exist that are heterogeneous in time and space, and it is unknown whether this represents the influence of extrinsic factors, such as selection and demographic fluctuation, or more intrinsic ones, such as cytonuclear interactions or the mosaic evolution of reproductive isolation. It is usually assumed, on the basis of the apparent lack of hybrids at zones of contact, that this phenomenon is unaccompanied by further admixture at nuclear loci, although this assumption rarely is tested. We present an analysis of population structure and gene flow across a zone of mitochondrial introgression between 2 nonsister species of chipmunk (Sciuridae: Tamias). We examined patterns of variation in 11 nuclear markers (10 microsatellites and 1 sequence-based marker) and compared them with previously identified patterns of mtDNA variation. We found little evidence of nuclear gene flow but some correspondence of introgression with microsatellite population structure. This work suggests that a complex interaction of ecological and genetic factors could have structured introgression of mtDNA in this system.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».