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Enregistrement W2169948124 · doi:10.1186/1471-2407-11-417

Cyclin D1, Id1 and EMT in breast cancer

2011· article· en· W2169948124 sur OpenAlexfundno aff
Nicholas P. Tobin, Andrew H. Sims, Katja Lundgren, Sophie Lehn, Göran Landberg

Notice bibliographique

RevueBMC Cancer · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueTGF-β signaling in diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of GeneticsMalmö HögskolaLunds UniversitetKnut och Alice Wallenbergs StiftelseVetenskapsrådetKarolinska InstitutetCancerfonden
Mots-clésCyclin D1Gene silencingCancer researchCell cycleCyclin DBreast cancerCyclin BBiologyCyclinCancerGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Cyclin D1 is a well-characterised cell cycle regulator with established oncogenic capabilities. Despite these properties, studies report contrasting links to tumour aggressiveness. It has previously been shown that silencing cyclin D1 increases the migratory capacity of MDA-MB-231 breast cancer cells with concomitant increase in 'inhibitor of differentiation 1' (ID1) gene expression. Id1 is known to be associated with more invasive features of cancer and with the epithelial-mesenchymal transition (EMT). Here, we sought to determine if the increase in cell motility following cyclin D1 silencing was mediated by Id1 and enhanced EMT-features. To further substantiate these findings we aimed to delineate the link between CCND1, ID1 and EMT, as well as clinical properties in primary breast cancer. METHODS: Protein and gene expression of ID1, CCND1 and EMT markers were determined in MDA-MB-231 and ZR75 cells by western blot and qPCR. Cell migration and promoter occupancy were monitored by transwell and ChIP assays, respectively. Gene expression was analysed from publicly available datasets. RESULTS: The increase in cell migration following cyclin D1 silencing in MDA-MB-231 cells was abolished by Id1 siRNA treatment and we observed cyclin D1 occupancy of the Id1 promoter region. Moreover, ID1 and SNAI2 gene expression was increased following cyclin D1 knock-down, an effect reversed with Id1 siRNA treatment. Similar migratory and SNAI2 increases were noted for the ER-positive ZR75-1 cell line, but in an Id1-independent manner. In a meta-analysis of 1107 breast cancer samples, CCND1low/ID1high tumours displayed increased expression of EMT markers and were associated with reduced recurrence free survival. Finally, a greater percentage of CCND1low/ID1high tumours were found in the EMT-like 'claudin-low' subtype of breast cancer than in other subtypes. CONCLUSIONS: These results indicate that increased migration of MDA-MB-231 cells following cyclin D1 silencing can be mediated by Id1 and is linked to an increase in EMT markers. Moreover, we have confirmed a relationship between cyclin D1, Id1 and EMT in primary breast cancer, supporting our in vitro findings that low cyclin D1 expression can be linked to aggressive features in subgroups of breast cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,255 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations145
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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