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Enregistrement W2169958136 · doi:10.1104/pp.109.143875

<i>SAUR39</i>, a Small Auxin-Up RNA Gene, Acts as a Negative Regulator of Auxin Synthesis and Transport in Rice  

2009· article· en· W2169958136 sur OpenAlexaff
Surya Kant, Yong‐Mei Bi, Tong Zhu, Steven J. Rothstein

Notice bibliographique

RevuePLANT PHYSIOLOGY · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Molecular Biology Research
Établissements canadiensUniversity of GuelphSyngenta (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAuxinBiologyMeristemCytokininOryza sativaGenetically modified ricePolar auxin transportArabidopsisWild typePlant physiologyAbscisic acidCell biologyGenetically modified cropsBotanyShootGeneTransgeneBiochemistryMutant

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The phytohormone auxin plays a critical role for plant growth by regulating the expression of a set of genes. One large auxin-responsive gene family of this type is the small auxin-up RNA (SAUR) genes, although their function is largely unknown. The expression of the rice (Oryza sativa) SAUR39 gene showed rapid induction by transient change in different environmental factors, including auxin, nitrogen, salinity, cytokinin, and anoxia. Transgenic rice plants overexpressing the SAUR39 gene resulted in lower shoot and root growth, altered shoot morphology, smaller vascular tissue, and lower yield compared with wild-type plants. The SAUR39 gene was expressed at higher levels in older leaves, unlike auxin biosynthesis, which occurs largely in the meristematic region. The transgenic plants had a lower auxin level and a reduced polar auxin transport as well as the down-regulation of some putative auxin biosynthesis and transporter genes. Biochemical analysis also revealed that transgenic plants had lower chlorophyll content, higher levels of anthocyanin, abscisic acid, sugar, and starch, and faster leaf senescence compared with wild-type plants at the vegetative stage. Most of these phenomena have been shown to be negatively correlated with auxin level and transport. Transcript profiling revealed that metabolic perturbations in overexpresser plants were largely due to transcriptional changes of genes involved in photosynthesis, senescence, chlorophyll production, anthocyanin accumulation, sugar synthesis, and transport. The lower growth and yield of overexpresser plants was largely recovered by exogenous auxin application. Taken together, the results suggest that SAUR39 acts as a negative regulator for auxin synthesis and transport.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,225
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations338
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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