Multiplex Real-Time PCR Assay for Detection of Influenza and Human Respiratory Syncytial Viruses
Notice bibliographique
Résumé
A multiplex real-time PCR assay was developed with a LightCycler instrument for detection of influenza viruses A and B and the human respiratory syncytial virus (HRSV). Detection of each viral product and of an internal control was based on determination of specific melting temperatures by the LightCycler software. The lower limit of detection in the multiplex PCR assay was found to be 50 copies for each viral target. In an evaluation of nasopharyngeal samples collected from hospitalized children (ages, 0 to 3 years) with acute respiratory tract infections during the winter of 2001 to 2002, a viral pathogen was detected by the multiplex PCR test in 139 (66.8%) of 208 cases, including 45 (21.6%) influenza A virus infections, no (0%) influenza B virus infections, 106 (51%) HRSV infections, and 12 (5.8%) coinfections. The multiplex PCR test was compared to rapid antigen detection assays for influenza viruses A and B (Directigen; Becton Dickinson, Sparks, Md.) and HRSV (RSV TestPack; Abbott Laboratories, Abbott Park, Ill.) in 172 and 204 samples, respectively. After resolution of discrepant test results by use of additional PCR assays targeting other viral genes, the sensitivity (Se) and specificity (Sp) of the multiplex PCR assay for influenza A virus were 100 and 97.7% compared to 43.6 and 98.5% for the antigenic test. Similarly, the Se and Sp of the multiplex PCR assay for HRSV were 94.5 and 98.9% compared to 81.6 and 94.7% for the antigenic test. In conclusion, our multiplex real-time PCR assay combines both rapidity and sensitivity for detecting the most important respiratory viral pathogens in children.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,004 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».