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Enregistrement W2170092556 · doi:10.1371/journal.pgen.1002171

Genome-Wide Association Study Identifies Novel Restless Legs Syndrome Susceptibility Loci on 2p14 and 16q12.1

2011· article· en· W2170092556 sur OpenAlexafffund
Juliane Winkelmann, Darina Czamara, Barbara Schormair, Eva C. Schulte, Claudia Trenkwalder, Yves Dauvilliers, Olli Polo, Birgit Högl, Andrea Fuhs, Nadine Groß, Karin Stiasny‐Kolster, Wolfgang H. Oertel, Cornelius G. Bachmann, Walter Paulus, Lan Xiong, Jacques Montplaisir, Guy A. Rouleau, Ingo Fietze, Jana Vávrová, David Kemlink, Karel Šonka, Soňa Nevšímalová, Siong-Chi Lin, Zbigniew K. Wszołek, Carles Vilariño‐Güell, Matthew J. Farrer, Viola Gschliesser, Birgit Frauscher, Tina Falkenstetter, Werner Poewe, Richard P. Allen, Christopher J. Earley, William G. Ondo, Wei-Dong Le, Derek Spieler, Maria Kaffe, Alexander Zimprich, Johannes Kettunen, Markus Perola, Kaisa Silander, Isabelle Cournu‐Rebeix, Marcella Francavilla, Claire Fontenille, Bertrand Fontaine, Pavel Vodička, Holger Prokisch, Peter Lichtner, Paul E. Peppard, Juliette Faraco, Emmanuel Mignot, Christian Gieger, Thomas Illig, H.‐Erich Wichmann, Bertram Müller‐Myhsok, Thomas Meitinger

Notice bibliographique

RevuePLoS Genetics · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRestless Legs Syndrome Research
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaHôpital du Sacré-Cœur de MontréalHôpital Notre-DameUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleDeutsche Migräne- und Kopfschmerzgesellschaft e.V.Ministerstvo Zdravotnictví Ceské RepublikyNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute of Nursing ResearchBundesministerium für Bildung und ForschungNational Institute on AgingInfrastructures en Biologie Santé et AgronomieFondation pour l'Aide à la Recherche sur la Sclérose en PlaquesPfizerRestless Legs Syndrome Foundation
Mots-clésLinkage disequilibriumBiologyGenome-wide association studySingle-nucleotide polymorphismRestless legs syndromeGeneticsLocus (genetics)PopulationGenetic associationTransmission disequilibrium testGenotypeMedicineGeneNeuroscience

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Restless legs syndrome (RLS) is a sensorimotor disorder with an age-dependent prevalence of up to 10% in the general population above 65 years of age. Affected individuals suffer from uncomfortable sensations and an urge to move in the lower limbs that occurs mainly in resting situations during the evening or at night. Moving the legs or walking leads to an improvement of symptoms. Concomitantly, patients report sleep disturbances with consequences such as reduced daytime functioning. We conducted a genome-wide association study (GWA) for RLS in 922 cases and 1,526 controls (using 301,406 SNPs) followed by a replication of 76 candidate SNPs in 3,935 cases and 5,754 controls, all of European ancestry. Herein, we identified six RLS susceptibility loci of genome-wide significance, two of them novel: an intergenic region on chromosome 2p14 (rs6747972, P = 9.03 × 10(-11), OR = 1.23) and a locus on 16q12.1 (rs3104767, P = 9.4 × 10(-19), OR = 1.35) in a linkage disequilibrium block of 140 kb containing the 5'-end of TOX3 and the adjacent non-coding RNA BC034767.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,101
Tête enseignante GPT0,315
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations197
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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