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Enregistrement W2170129382 · doi:10.3168/jds.s0022-0302(04)73502-x

A Study of β-Casein Tertiary Structure by Intramolecular Crosslinking and Mass Spectrometry

2004· article· en· W2170129382 sur OpenAlexafffund
Yoav D. Livney, Adrian L. Schwan, Douglas G. Dalgleish

Notice bibliographique

RevueJournal of Dairy Science · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueProteins in Food Systems
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of Guelph
Mots-clésIntramolecular forceChemistryMass spectrometryRandom coilMoleculeProtein tertiary structureIntermolecular forceMatrix-assisted laser desorption/ionizationStereochemistryDesorptionChromatographyOrganic chemistryCircular dichroismBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The objective of this study was to obtain experimental evidence to extend the discussion on the 3-D structure of beta-casein (beta-CN). The approach involved the preparation of homobifunctional crosslinkers, bis(sulfosuccinimidyl) derivatives of dicarboxylic acids of several lengths, which specifically react with primary amines of lysinyl residues or the N-terminal in the protein. The intramolecular crosslinks formed were determined by enzymatic digestion and by matrix-assisted laser desorption and ionization time-of-flight mass spectrometry combined with comparison against the theoretical digestion patterns. This procedure allowed the measurement of distances between the crosslinked residues. Ten different masses arising from 8 different specific intramolecular crosslinks were identified. Of these, 5 crosslinks were in good agreement with a published model (Kumosinski et al., 1993). Two other crosslinks each connected 2 residues that are much closer together, according to the model, than the maximum length of the crosslink. However, one of the crosslinks apparently connected 2 residues that are predicted by the model to be 16.7 A farther apart than the crosslink's stretched length. This disparity might be explained by structural flexibility. The structure expressed by the model is probably one of several energetically favorable conformations of the beta-CN molecule, whose structure is best described as rheomorphic rather than either a fixed structure or a random coil.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,280
Score d'incertitude au seuil0,152

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations57
Publié2004
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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