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Enregistrement W2170212739 · doi:10.1095/biolreprod.107.065060

RAB2A: A Major Subacrosomal Protein of Bovine Spermatozoa Implicated in Acrosomal Biogenesis1

2008· article· en· W2170212739 sur OpenAlexaff
Jeremi R. Mountjoy, Wei Xu, Dave McLeod, D. W. Hyndman, Richard Oko

Notice bibliographique

RevueBiology of Reproduction · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSperm and Testicular Function
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologySubfamilySpermiogenesisGolgi apparatusPeptide sequenceSpermatidWestern blotTrypsinMolecular biologyBiochemistrySpermEnzymeEndoplasmic reticulumGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The perinuclear theca (PT) of mammalian sperm is a unique subcellular structure encapsulating the nucleus. Compositionally, the PT is made up of at least six prominent polypeptides (60, 36, 31, 28, 24, and 15 kDa), of which only two have been sequence identified, as well as many less prominent ones. As an ongoing process in unveiling the protein composition of the PT, we have uncovered the sequence identity of the prominent 24-kDa polypeptide (PT24). Initial N-terminal sequence analysis obtained by Edman degradation suggested that PT24 is a RAB2 protein. This was corroborated by mass spectrometric analyses of trypsin-digested fragments of PT24, identifying RAB2A of the RAB2 subfamily as the best sequence match. Quadrapole/time-of-flight analysis identified 72%% sequence coverage between PT24 and bull, human, mouse, or rabbit RAB2A. Since a genome search only identified two RAB2 subfamily members, RAB2A and RAB2B, the 72%% sequence coverage of PT24 provides assurance that this protein is RAB2A and not a new RAB2 subfamily member. Furthermore, commercial RAB2A antibodies, raised against oligopeptide fragments in the unique C-terminal region of RAB2A, specifically labeled PT24 on Western blot analysis of PT extracts. These anti-RAB2A antibodies, along with immune serum that we raised and affinity purified against isolated PT24, demonstrated at both light and electron microscope levels that RAB2 is associated with the periphery of the growing proacrosomic and acrosomic vesicles in the Golgi and cap phases of spermiogenesis and consequently assembled as part of the PT. This pattern of subacrosomal assembly is reminiscent of the pathway used by SubH2Bv (PT15), another prominent and exclusive subacrosomal protein, indicating a common route for subacrosomal-PT assembly. Traditionally somatic RAB2 proteins are involved in vesicular transport between the endoplasmic reticulum and the cis-side of the Golgi apparatus. Our study suggests an unprecedented direction of RAB2A-mediated vesicular transport in spermatids during acrosomal biogenesis, from the trans-side of the Golgi apparatus to the nuclear envelope.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,117
Score d'incertitude au seuil0,418

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations61
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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