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Enregistrement W2170395607 · doi:10.1093/hmg/ddu461

Mutation of SLC9A1, encoding the major Na+/H+ exchanger, causes ataxia-deafness Lichtenstein-Knorr syndrome

2014· article· en· W2170395607 sur OpenAlexafffund
Claire Guissart, Xinrui Li, Bruno Leheup, Nathalie Drouot, B. Montaut-Verient, Emmanuel Raffo, P. Jonveaux, Anne‐Françoise Roux, Mireille Claustres, Larry Fliegel

Notice bibliographique

RevueHuman Molecular Genetics · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchAgence Nationale de la Recherche
Mots-clésMissense mutationAtaxiaGeneticsExome sequencingMutationPhenotypeSensorineural hearing lossHearing lossMutantBiologyLoss functionCerebellar ataxiaGeneMedicineAudiologyNeuroscience

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Lichtenstein-Knorr syndrome is an autosomal recessive condition that associates sensorineural hearing loss and cerebellar ataxia. Here, we report the first identification of a gene involved in Lichtenstein-Knorr syndrome. By using a combination of homozygosity mapping and whole-exome sequencing, we identified the homozygous p.Gly305Arg missense mutation in SLC9A1 that segregates with the disease in a large consanguineous family. Mutant glycine 305 is a highly conserved amino acid present in the eighth transmembrane segment of all metazoan orthologues of NHE1, the Na(+)/H(+) exchanger 1, encoded by SLC9A1. We demonstrate that the p.Gly305Arg mutation causes the near complete de-glycosylation, mis-targeting and loss of proton pumping activity of NHE1. The comparison of our family with the phenotypes of spontaneous and knockout Slc9a1 murine models demonstrates that the association between ataxia and hearing loss is caused by complete or near complete loss of function of NHE1 and altered regulation of pHi in the central nervous system.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,042
Score d'incertitude au seuil0,705

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations47
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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